More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3507 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 491 aa  942    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  81.93 
 
 		 496 aa  689    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  46.05 
 
 		 485 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  38.84 
 
 		 483 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  38.54 
 
 		 516 aa  292  9e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  36.67 
 
 		 467 aa  280  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  39.04 
 
 		 495 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  38.52 
 
 		 484 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  40.39 
 
 		 509 aa  274  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  38.99 
 
 		 497 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  38.14 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  36.1 
 
 		 479 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  36.1 
 
 		 479 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  42.29 
 
 		 498 aa  263  6e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  37.3 
 
 		 464 aa  259  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  33.62 
 
 		 510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  33.62 
 
 		 510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  33.62 
 
 		 510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  37.34 
 
 		 485 aa  254  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  42.05 
 
 		 497 aa  247  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  32.48 
 
 		 513 aa  246  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  38 
 
 		 488 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  41.59 
 
 		 486 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  36.6 
 
 		 510 aa  244  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  36.86 
 
 		 509 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  32.84 
 
 		 516 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  31.97 
 
 		 510 aa  239  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  38.33 
 
 		 484 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  36.33 
 
 		 492 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  35.51 
 
 		 490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 493 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  33.94 
 
 		 481 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  32.71 
 
 		 487 aa  207  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  32.08 
 
 		 474 aa  206  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  31.12 
 
 		 504 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  32.91 
 
 		 486 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  37.14 
 
 		 483 aa  201  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  31.3 
 
 		 485 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 		 527 aa  176  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  32.7 
 
 		 504 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  30.33 
 
 		 502 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  32.88 
 
 		 507 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 492 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 492 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 492 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  27.06 
 
 		 449 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  27.59 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 497 aa  73.6  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  24.74 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  25.48 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 521 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  25.26 
 
 		 465 aa  67  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3002  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.993611  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 		 490 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 450 aa  66.6  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 		 516 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1698  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.471872  normal  0.470522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  26.58 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02211  amino acid transporter  29.94 
 
 		 462 aa  63.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  26.02 
 
 		 434 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  28.74 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  26.68 
 
 		 489 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 449 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  24.43 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  27.02 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  25.61 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  23.53 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 506 aa  59.3  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3457  amino acid permease-associated region  32.17 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.553768  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1392  arginine/ornithine antiporter  29.03 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.679815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  23.35 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  24.24 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  24.5 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  23.2 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  24.5 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  24.5 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  24.5 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.57 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  23.2 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  24.5 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  29.73 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  29.03 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  26.98 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  23.27 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>