More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0779 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  100 
 
 		 417 aa  815    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  96.4 
 
 		 417 aa  761    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  76.03 
 
 		 416 aa  621  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  76.03 
 
 		 416 aa  621  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  76.03 
 
 		 416 aa  621  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  77.21 
 
 		 417 aa  585  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  77.37 
 
 		 417 aa  585  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  75.06 
 
 		 422 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  66.83 
 
 		 418 aa  521  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  65.85 
 
 		 445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  67.56 
 
 		 483 aa  512  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  67.07 
 
 		 418 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  67.07 
 
 		 418 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  67.07 
 
 		 418 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  66.83 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  66.83 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  66.83 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  66.83 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4606  inner membrane protein YjeH  60.44 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4689  inner membrane protein YjeH  60.44 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4598  inner membrane protein YjeH  60.44 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4725  inner membrane protein YjeH  60.44 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.201688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4746  inner membrane protein YjeH  60.44 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.733754  normal  0.566679 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  44.63 
 
 		 420 aa  329  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  43.55 
 
 		 420 aa  326  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  44.89 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  53.68 
 
 		 417 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  33.08 
 
 		 425 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  33.57 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  33.75 
 
 		 418 aa  203  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  32.51 
 
 		 427 aa  203  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  33.33 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  33.33 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  33.33 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  33.33 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  35.77 
 
 		 419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  32.6 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  31.87 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  34.86 
 
 		 421 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  31.63 
 
 		 422 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  31.63 
 
 		 422 aa  190  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  31.37 
 
 		 426 aa  186  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  29.9 
 
 		 425 aa  149  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  27.27 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  27.27 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  28.68 
 
 		 431 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  26.84 
 
 		 426 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  27.96 
 
 		 416 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  23.91 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  25.24 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  25.24 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  25.24 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  25.24 
 
 		 428 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  31.26 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  24.94 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  31.16 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 428 aa  99.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  25.65 
 
 		 475 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3765  amino acid permease-associated region  33.03 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3457  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.553768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  27.19 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  47.67 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  47.67 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  47.67 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1748  amino acid permease  47.67 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228766  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1833  amino acid transporters  47.67 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0307  amino acid permease  47.67 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.4886  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  47.67 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  21.32 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  25.54 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  45.35 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  43.62 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  45.35 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  43.62 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  43.62 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4417  amino acid permease-associated region  43.62 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  43.62 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6652  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1129  amino acid permease  45.35 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00552424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 466 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1674  phospholipid binding protein  25.82 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.054806  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 466 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 641 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  30.26 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  29.09 
 
 		 468 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1109  amino acid permease-associated region  21.41 
 
 		 418 aa  67  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.632191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3254  putrescine transporter  25 
 
 		 442 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 		 479 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  25.34 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  24.43 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1807  amino acid permease-associated region  21.17 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  25.44 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>