More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1386 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 434 aa  858    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  43.24 
 
 		 475 aa  358  7e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3197  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  29.35 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  26.27 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  26.27 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  26.09 
 
 		 426 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  26.16 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  25.47 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  25.47 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  25.23 
 
 		 428 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  25.23 
 
 		 428 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  25.24 
 
 		 428 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  23.27 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  23.82 
 
 		 425 aa  97.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 416 aa  93.6  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  24.69 
 
 		 425 aa  92.8  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  25.81 
 
 		 420 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  25.81 
 
 		 420 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  25.81 
 
 		 420 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  25.81 
 
 		 420 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  24.24 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  23.48 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  21.43 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  22.2 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  21.38 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  24.05 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  24.13 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  23.64 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  23.8 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  22.77 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  20.63 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  24.56 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  23.23 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  24.26 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  22.1 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  21.08 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  22.77 
 
 		 421 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  21.08 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  21.08 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  27.96 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  27.5 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  24.74 
 
 		 465 aa  70.1  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  22.35 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  25.12 
 
 		 451 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  26.42 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  22 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  22.35 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  22.55 
 
 		 422 aa  67  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  22.12 
 
 		 467 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  28.97 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  22.12 
 
 		 467 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  24.88 
 
 		 451 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  27.78 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  22.12 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  20.63 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  20.63 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  20.63 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  20.63 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  20.63 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  20.63 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 764 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  21.11 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  29.61 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  20.63 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  21.9 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  21.9 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 538 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  28.26 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  28.26 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  28.26 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  28.26 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  21.03 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  21.9 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  28.28 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  20.21 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  23.72 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2580  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  19.95 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  19.75 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  19.75 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1807  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  22.12 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1498  amino acid permease-associated region  22.94 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333437  normal  0.389664 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  21.67 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  23.38 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 716 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1067  putrescine transporter  21.43 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  19.7 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>