More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4670 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  98.8 
 
 		 418 aa  814    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  99.52 
 
 		 418 aa  818    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  98.8 
 
 		 418 aa  814    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  82.68 
 
 		 445 aa  655    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  100 
 
 		 418 aa  823    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  99.52 
 
 		 418 aa  818    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  98.33 
 
 		 483 aa  816    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  99.04 
 
 		 418 aa  815    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  99.52 
 
 		 418 aa  818    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  99.28 
 
 		 418 aa  816    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  70.07 
 
 		 416 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  70.07 
 
 		 416 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  70.07 
 
 		 416 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  70.94 
 
 		 417 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4746  inner membrane protein YjeH  71.22 
 
 		 420 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.733754  normal  0.566679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4725  inner membrane protein YjeH  71.22 
 
 		 420 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.201688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4689  inner membrane protein YjeH  71.22 
 
 		 420 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4606  inner membrane protein YjeH  71.22 
 
 		 420 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4598  inner membrane protein YjeH  71.22 
 
 		 420 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  67.32 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  66.83 
 
 		 417 aa  524  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  67.32 
 
 		 422 aa  498  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  65.7 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  45.45 
 
 		 420 aa  345  8e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  45.67 
 
 		 420 aa  343  5e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  46.85 
 
 		 440 aa  330  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  54.03 
 
 		 417 aa  299  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  35.24 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  37.31 
 
 		 419 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  34.52 
 
 		 425 aa  222  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  35.41 
 
 		 422 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  34.51 
 
 		 418 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  36.52 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  33.67 
 
 		 422 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  33.42 
 
 		 422 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  33.17 
 
 		 422 aa  192  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  33.85 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  31.17 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  32.17 
 
 		 420 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  32.17 
 
 		 420 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  32.17 
 
 		 420 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  32.17 
 
 		 420 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  31.99 
 
 		 431 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  29.9 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  27.76 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  27.76 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  27.59 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  26.07 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  26.33 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  26.07 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  26.33 
 
 		 428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  27.41 
 
 		 428 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  26.14 
 
 		 422 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  34.7 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  34.7 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  34.7 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  34.7 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1833  amino acid transporters  34.7 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1748  amino acid permease  34.7 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0307  amino acid permease  34.7 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.4886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  26.95 
 
 		 430 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  31.43 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  31.43 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  31.47 
 
 		 442 aa  103  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1129  amino acid permease  32.77 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00552424  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  38.39 
 
 		 424 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  38.43 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  38.43 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  38.43 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4417  amino acid permease-associated region  38.84 
 
 		 424 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  30.5 
 
 		 461 aa  96.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2580  amino acid permease-associated region  30.91 
 
 		 428 aa  92.8  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  24.35 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 716 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3765  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6652  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  25.06 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  21.14 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3457  amino acid permease-associated region  24.82 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.553768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 469 aa  76.3  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 		 470 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  33.78 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  26.64 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  27.69 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  23.72 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  27.25 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  25.59 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  29.75 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3197  amino acid permease-associated region  22.58 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>