More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3458 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  100 
 
 		 418 aa  813    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  66.18 
 
 		 422 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  65.7 
 
 		 422 aa  519  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  66.26 
 
 		 426 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  65.22 
 
 		 422 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  64.41 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  64.58 
 
 		 420 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  64.58 
 
 		 420 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  64.58 
 
 		 420 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  63.92 
 
 		 419 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  64.58 
 
 		 420 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  62.77 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  63.07 
 
 		 422 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  62.95 
 
 		 421 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  34.82 
 
 		 420 aa  226  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  34.35 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  34.76 
 
 		 418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  34.41 
 
 		 483 aa  209  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  34.76 
 
 		 418 aa  209  9e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  34.76 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  34.76 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  34.76 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  33.33 
 
 		 416 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  34.76 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  33.33 
 
 		 416 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  33.33 
 
 		 416 aa  209  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  34.76 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  34.76 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  35.48 
 
 		 422 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  33.17 
 
 		 445 aa  207  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  34.59 
 
 		 417 aa  202  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  33.67 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  33.83 
 
 		 417 aa  199  9e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  34.27 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4689  inner membrane protein YjeH  34.66 
 
 		 420 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4606  inner membrane protein YjeH  34.66 
 
 		 420 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4746  inner membrane protein YjeH  34.66 
 
 		 420 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.733754  normal  0.566679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4725  inner membrane protein YjeH  34.66 
 
 		 420 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.201688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4598  inner membrane protein YjeH  34.66 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  34.85 
 
 		 417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  29.36 
 
 		 425 aa  169  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  36.22 
 
 		 417 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  25.3 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  25.06 
 
 		 431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  25.06 
 
 		 431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 416 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  25.25 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 		 425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  25.94 
 
 		 428 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  25.94 
 
 		 428 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  32.43 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  25.33 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  25.33 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0307  amino acid permease  31.44 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.4886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  32.16 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1748  amino acid permease  31.44 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228766  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  32.16 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  32.16 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1833  amino acid transporters  31.17 
 
 		 431 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  24.34 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 		 430 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  27.03 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1674  phospholipid binding protein  25.58 
 
 		 438 aa  99.8  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.054806  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  30.06 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2580  amino acid permease-associated region  31.01 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  29.24 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  31.37 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1129  amino acid permease  29.62 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00552424  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  31.37 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  29.78 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  31.37 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  23.48 
 
 		 411 aa  90.9  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  24.3 
 
 		 460 aa  90.1  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  28.93 
 
 		 424 aa  90.1  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3457  amino acid permease-associated region  27.12 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.553768  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4417  amino acid permease-associated region  31.09 
 
 		 424 aa  87.4  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3197  amino acid permease-associated region  23.1 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048161 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  27.76 
 
 		 450 aa  86.7  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  29.81 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  23.11 
 
 		 452 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3702  arginine:agmatin antiporter  26.76 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1805  amino acid permease-associated region  27.1 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607317  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3765  amino acid permease-associated region  29.95 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 503 aa  77  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 		 473 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  23.1 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  26.03 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  25.45 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2717  lysine/cadaverine antiporter  23.4 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2821  lysine/cadaverine antiporter  23.4 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2759  lysine/cadaverine antiporter  23.4 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2934  lysine/cadaverine antiporter  23.4 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.252343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>