More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0559 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 416 aa  807    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  57.59 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  54.52 
 
 		 425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  34.72 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  34.72 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  34.96 
 
 		 428 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  34.96 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  37.06 
 
 		 431 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  37.06 
 
 		 431 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  34.72 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  37.06 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  32.2 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  33.42 
 
 		 431 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  33.42 
 
 		 431 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  33.42 
 
 		 431 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  33.75 
 
 		 428 aa  169  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  33.42 
 
 		 420 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2580  amino acid permease-associated region  34.86 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1748  amino acid permease  33.42 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0307  amino acid permease  33.42 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.4886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1833  amino acid transporters  33.42 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273925  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  32 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  32.81 
 
 		 442 aa  160  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  32 
 
 		 424 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  38.46 
 
 		 445 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  38.46 
 
 		 445 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  38.46 
 
 		 445 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  38.46 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1129  amino acid permease  33.66 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00552424  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4417  amino acid permease-associated region  38.85 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  32.05 
 
 		 461 aa  150  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  26.99 
 
 		 427 aa  144  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6652  amino acid permease-associated region  35.68 
 
 		 417 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  27.43 
 
 		 422 aa  136  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  26.73 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  26.73 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  26.73 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  26.73 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  27.12 
 
 		 421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  26.7 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3765  amino acid permease-associated region  32.45 
 
 		 429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  27.32 
 
 		 440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  25.85 
 
 		 422 aa  127  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  28.3 
 
 		 417 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  29.03 
 
 		 416 aa  126  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  29.03 
 
 		 416 aa  126  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  29.03 
 
 		 416 aa  126  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  25.85 
 
 		 422 aa  126  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  25.71 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  25.6 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  27.08 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  27.14 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  27.53 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  30.13 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3197  amino acid permease-associated region  27.1 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 430 aa  117  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  26.3 
 
 		 420 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  26.72 
 
 		 419 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  28.54 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  30.13 
 
 		 418 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  30.13 
 
 		 418 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  30.13 
 
 		 418 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  29.95 
 
 		 422 aa  109  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  30.13 
 
 		 418 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.92 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.92 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  27.32 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  32.51 
 
 		 740 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  29.87 
 
 		 418 aa  107  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  29.38 
 
 		 483 aa  107  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  29.87 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  29.87 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  24.69 
 
 		 425 aa  106  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  27.41 
 
 		 471 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  27.96 
 
 		 417 aa  102  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.41 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 725 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  25.9 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  29.65 
 
 		 473 aa  100  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  28.08 
 
 		 417 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.08 
 
 		 467 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25.08 
 
 		 467 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  27.62 
 
 		 753 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25.08 
 
 		 467 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.08 
 
 		 467 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  27.95 
 
 		 475 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25.08 
 
 		 467 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  27.24 
 
 		 716 aa  97.8  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  24.14 
 
 		 467 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4689  inner membrane protein YjeH  28.07 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4725  inner membrane protein YjeH  28.07 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.201688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  24.76 
 
 		 467 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4598  inner membrane protein YjeH  28.07 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 467 aa  97.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4746  inner membrane protein YjeH  28.07 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.733754  normal  0.566679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4606  inner membrane protein YjeH  28.07 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 439 aa  96.7  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  24.45 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  24.45 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 		 786 aa  94.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>