More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6652 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6652  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 417 aa  775    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  46.69 
 
 		 424 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  46.69 
 
 		 423 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  38.65 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  43.14 
 
 		 420 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  43.14 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  43.14 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  43.14 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  32 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  45.59 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  45.59 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  45.59 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  45.78 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0307  amino acid permease  43.42 
 
 		 431 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.4886  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1748  amino acid permease  43.42 
 
 		 431 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228766  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1833  amino acid transporters  43.42 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273925  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  41.85 
 
 		 461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  36.17 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4417  amino acid permease-associated region  45.96 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 		 416 aa  150  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1129  amino acid permease  48.31 
 
 		 431 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00552424  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2580  amino acid permease-associated region  43.21 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  24.11 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  24.11 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  24.11 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  27.79 
 
 		 428 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  27.79 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  27.79 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  27.79 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  32.64 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3765  amino acid permease-associated region  38.97 
 
 		 429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  26.54 
 
 		 440 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3197  amino acid permease-associated region  24.82 
 
 		 435 aa  96.3  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048161 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  26.11 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  29.15 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  27.83 
 
 		 422 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  26.3 
 
 		 445 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  26.68 
 
 		 416 aa  88.2  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  26.68 
 
 		 416 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  26.68 
 
 		 416 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  23.02 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  27.95 
 
 		 466 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  27.95 
 
 		 466 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.95 
 
 		 466 aa  86.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25.75 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.75 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25.75 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  26.75 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  25.75 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  25.75 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.75 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.75 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25.75 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  25.75 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  29.35 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  26.11 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  26.11 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  27.71 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  29.09 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  26.42 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  26.68 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  26.11 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  26.42 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  27.71 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  26.42 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1055  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.123493  hitchhiker  0.0000000766356 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  29.05 
 
 		 506 aa  79.7  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.41 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.41 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.41 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.41 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.41 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.41 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  24.7 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.41 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  29.18 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  26.41 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  27.08 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.44 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  26.41 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  30.49 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 		 740 aa  77.4  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  25.11 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  25.11 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  28.35 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1866  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.17 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.17 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25.17 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>