More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS2988 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  100 
 
 		 428 aa  837    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  99.53 
 
 		 428 aa  833    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  97.43 
 
 		 428 aa  790    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  99.77 
 
 		 428 aa  834    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  100 
 
 		 428 aa  837    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  36.98 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  35.19 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  35.19 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  35.19 
 
 		 426 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  33.98 
 
 		 425 aa  244  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  35.27 
 
 		 431 aa  243  6e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  34.72 
 
 		 416 aa  237  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  32.61 
 
 		 431 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  32.61 
 
 		 431 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  32.61 
 
 		 431 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  32.86 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1833  amino acid transporters  32.61 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0307  amino acid permease  32.37 
 
 		 431 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.4886  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1748  amino acid permease  32.37 
 
 		 431 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228766  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  37.42 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  37.42 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1129  amino acid permease  34.3 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00552424  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  32.05 
 
 		 442 aa  196  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  32.84 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  31.5 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  37.42 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  37.42 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  37.42 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  38.66 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4417  amino acid permease-associated region  38.02 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2580  amino acid permease-associated region  31.28 
 
 		 428 aa  159  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3765  amino acid permease-associated region  31.63 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  27.45 
 
 		 418 aa  143  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  27.93 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  27.72 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  27.66 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  27.66 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  25.71 
 
 		 416 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  25.71 
 
 		 416 aa  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  25.71 
 
 		 416 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 418 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  27.45 
 
 		 418 aa  137  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  27.45 
 
 		 418 aa  137  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  27.39 
 
 		 418 aa  136  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  29.49 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  27.03 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  25.33 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  26.72 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  25.54 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  25.13 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  25.13 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  25.13 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  25.13 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  27.01 
 
 		 420 aa  123  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  25.4 
 
 		 417 aa  122  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6652  amino acid permease-associated region  33.47 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  25 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  26.97 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  25.55 
 
 		 417 aa  120  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  25.2 
 
 		 420 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  26.53 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  24.6 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  24.34 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  24.8 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  25.13 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  25.8 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  25.06 
 
 		 426 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  26.36 
 
 		 440 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  25.91 
 
 		 417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  26.06 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 439 aa  114  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  24.18 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  24.63 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 740 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1067  putrescine transporter  23.04 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  26.98 
 
 		 430 aa  103  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.46 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 486 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.46 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.46 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.46 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.46 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4598  inner membrane protein YjeH  24.6 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.46 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  27.68 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 496 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 496 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.16 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0180  putrescine transporter  24.69 
 
 		 439 aa  100  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  23.56 
 
 		 463 aa  99.8  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  23.56 
 
 		 463 aa  99.8  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4689  inner membrane protein YjeH  24.07 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4606  inner membrane protein YjeH  24.07 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4746  inner membrane protein YjeH  24.07 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.733754  normal  0.566679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 496 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4725  inner membrane protein YjeH  24.07 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.201688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  24.88 
 
 		 542 aa  99.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>