More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0619 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 430 aa  838    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3197  amino acid permease-associated region  30.07 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048161 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  29 
 
 		 425 aa  156  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  24.65 
 
 		 431 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  24.65 
 
 		 431 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  24.48 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  28.92 
 
 		 475 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  29.35 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  26.96 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  30.85 
 
 		 417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 431 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  27.29 
 
 		 420 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  29.37 
 
 		 770 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  29.49 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  28.94 
 
 		 786 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  26.28 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  25.35 
 
 		 422 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  26.93 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  26.93 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  26.93 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.65 
 
 		 471 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  27.22 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  29.5 
 
 		 429 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  29.09 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  25.6 
 
 		 427 aa  106  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  28.18 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  28.18 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  28.18 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  28.18 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  26.07 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  26.07 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  26.07 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  28.53 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  27.03 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  28.53 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  28.23 
 
 		 422 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  30.75 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  26.35 
 
 		 460 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  30.75 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  29.34 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  27.71 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  30.75 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  30.75 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  28.22 
 
 		 474 aa  99.8  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  25.42 
 
 		 420 aa  99.8  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  25.88 
 
 		 421 aa  99.8  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  26.25 
 
 		 445 aa  99  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  28.91 
 
 		 436 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  27.3 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.47 
 
 		 471 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  26.63 
 
 		 471 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.47 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.47 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.47 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.23 
 
 		 471 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.47 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.47 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  26.28 
 
 		 428 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1833  amino acid transporters  30.75 
 
 		 431 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  25.96 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0307  amino acid permease  30.75 
 
 		 431 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.4886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  25.96 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  26.54 
 
 		 418 aa  96.7  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  28.08 
 
 		 641 aa  96.7  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1748  amino acid permease  30.75 
 
 		 431 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  26.28 
 
 		 428 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  25.18 
 
 		 471 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  25.18 
 
 		 471 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  29.48 
 
 		 753 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3457  amino acid permease-associated region  30.03 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.553768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 441 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  25.42 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 		 471 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  25.18 
 
 		 471 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  24.7 
 
 		 471 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 518 aa  93.2  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  26.54 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  26.54 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  26.54 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  26.54 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  26.54 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  26.54 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  26.54 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3765  amino acid permease-associated region  31.07 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  25.59 
 
 		 462 aa  91.3  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  32.13 
 
 		 424 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 444 aa  90.1  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  32.13 
 
 		 423 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  24.82 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  23.45 
 
 		 466 aa  89.4  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  26.63 
 
 		 471 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  28.18 
 
 		 443 aa  88.2  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  26.53 
 
 		 422 aa  88.2  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1129  amino acid permease  29.67 
 
 		 431 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00552424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  24.81 
 
 		 417 aa  86.7  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  23.59 
 
 		 764 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>