More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0328 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  82.68 
 
 
418 aa  655    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  83.17 
 
 
418 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  82.93 
 
 
418 aa  638    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  83.17 
 
 
418 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  82.93 
 
 
418 aa  638    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  83.17 
 
 
418 aa  639    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.915973 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  83.17 
 
 
418 aa  639    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  82.93 
 
 
418 aa  638    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  100 
 
 
445 aa  882    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  82.44 
 
 
483 aa  640    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0960639 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  70 
 
 
416 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  70 
 
 
416 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  70 
 
 
416 aa  586  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  69.46 
 
 
417 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4598  inner membrane protein YjeH  70.73 
 
 
420 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4606  inner membrane protein YjeH  70.49 
 
 
420 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4746  inner membrane protein YjeH  70.49 
 
 
420 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.733754  normal  0.566679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4725  inner membrane protein YjeH  70.49 
 
 
420 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.201688  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4689  inner membrane protein YjeH  70.49 
 
 
420 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  65.85 
 
 
417 aa  518  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  65.61 
 
 
417 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  66.09 
 
 
422 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  66.1 
 
 
417 aa  498  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  45.52 
 
 
440 aa  333  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  44.47 
 
 
420 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  43.64 
 
 
420 aa  328  9e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  53.39 
 
 
417 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  35.82 
 
 
427 aa  226  7e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  36.52 
 
 
419 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  36.14 
 
 
422 aa  216  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  33.25 
 
 
418 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  33.74 
 
 
425 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  35.52 
 
 
421 aa  193  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  32.67 
 
 
420 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  31.67 
 
 
422 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  32.32 
 
 
426 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  31.42 
 
 
422 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  31.17 
 
 
422 aa  179  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  32.43 
 
 
420 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  32.43 
 
 
420 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  32.43 
 
 
420 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  32.43 
 
 
420 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  28.06 
 
 
431 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  28.06 
 
 
431 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 
431 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  28.09 
 
 
426 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 
425 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  25.19 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  26.97 
 
 
428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  26.97 
 
 
428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 
416 aa  120  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  27.25 
 
 
428 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  27.25 
 
 
428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  27.36 
 
 
428 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  29.01 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 
430 aa  103  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  31.18 
 
 
442 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  29.26 
 
 
423 aa  96.3  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  34.73 
 
 
424 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  30.12 
 
 
461 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  29.36 
 
 
424 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  34.84 
 
 
445 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  34.84 
 
 
445 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  34.84 
 
 
445 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  26.2 
 
 
475 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4417  amino acid permease-associated region  34.73 
 
 
424 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306277  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6652  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 
417 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3457  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.553768  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  53.09 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0307  amino acid permease  53.09 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.4886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  53.09 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1748  amino acid permease  53.09 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228766  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1833  amino acid transporters  53.09 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273925  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  53.09 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  53.09 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  29.39 
 
 
475 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  24.09 
 
 
440 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  23.56 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  33.77 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  26.84 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  30.49 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3765  amino acid permease-associated region  32.98 
 
 
429 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  26.79 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1129  amino acid permease  50.62 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00552424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1498  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 
445 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333437  normal  0.389664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  31.42 
 
 
452 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 
473 aa  67  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  21.89 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 
479 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1109  amino acid permease-associated region  21.54 
 
 
418 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.632191  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  28.36 
 
 
495 aa  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2717  lysine/cadaverine antiporter  27.49 
 
 
443 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2759  lysine/cadaverine antiporter  27.49 
 
 
443 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2934  lysine/cadaverine antiporter  27.49 
 
 
443 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.252343  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  24.22 
 
 
461 aa  66.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2800  lysine/cadaverine antiporter  27.49 
 
 
443 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.1623  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 
439 aa  66.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 
436 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>