More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1067 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001093  putrescine/proton symporter putrescine/ornithine antiporter PotE  80.56 
 
 		 436 aa  731    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04834  putrescine transporter  80.79 
 
 		 436 aa  729    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1067  putrescine transporter  100 
 
 		 439 aa  882    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0747  putrescine transporter  67.37 
 
 		 439 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110662  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0808  putrescine transporter  67.37 
 
 		 439 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0760  putrescine transporter  67.37 
 
 		 439 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal  0.419082 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0821  putrescine transporter  67.37 
 
 		 439 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.438039  normal  0.147845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0857  putrescine transporter  67.37 
 
 		 439 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0714  putrescine transporter  65.81 
 
 		 439 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0136028  normal  0.578449 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00648  putrescine/proton symporter: putrescine/ornithine antiporter  65.97 
 
 		 439 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2945  arginine/ornithine antiporter  65.97 
 
 		 439 aa  581  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2964  putrescine transporter  65.97 
 
 		 439 aa  581  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.018093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00640  hypothetical protein  65.97 
 
 		 439 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.167643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0784  putrescine transporter  65.97 
 
 		 439 aa  581  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0285849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1204  putrescine transporter  64.73 
 
 		 437 aa  579  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.658764  decreased coverage  0.0000377329 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0717  putrescine transporter  65.5 
 
 		 439 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193165  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3335  putrescine transporter  64.49 
 
 		 438 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0313  putrescine transporter  62.96 
 
 		 439 aa  561  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3680  putrescine transporter  62.39 
 
 		 439 aa  560  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0180  putrescine transporter  62.9 
 
 		 439 aa  559  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3668  putrescine transporter  63.72 
 
 		 439 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0277  putrescine transporter  63.72 
 
 		 439 aa  561  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0508  putrescine transporter  65.5 
 
 		 440 aa  558  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3872  putrescine transporter  63.72 
 
 		 439 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0414158 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4054  putrescine transporter  63.23 
 
 		 439 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3976  putrescine transporter  63.23 
 
 		 439 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4172  putrescine transporter  63.23 
 
 		 439 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4085  putrescine transporter  63.23 
 
 		 439 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1574  putrescine transporter  61.72 
 
 		 436 aa  552  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3513  putrescine transporter  58.76 
 
 		 461 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015578 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4355  putrescine transporter  58.29 
 
 		 461 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879219  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4011  putrescine transporter  58.29 
 
 		 461 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5194  putrescine transporter  53.97 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6446  amino acid permease-associated region  51.4 
 
 		 750 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2445  putrescine transporter  49.54 
 
 		 446 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273787  normal  0.196088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2989  putrescine transporter  47.67 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00443871  normal  0.0573626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3254  putrescine transporter  48.12 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4860  arginine:agmatin antiporter  34.79 
 
 		 508 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086172  hitchhiker  0.00303215 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3702  arginine:agmatin antiporter  34.33 
 
 		 509 aa  273  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0780  arginine:agmatin antiporter  34.33 
 
 		 510 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.0754473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4344  arginine:agmatin antiporter  34.33 
 
 		 508 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.620829  hitchhiker  0.000578907 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  35.41 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  35.41 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  35.41 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  35.41 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  35.41 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  35.41 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  35.41 
 
 		 445 aa  265  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  35.41 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  35.41 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  34.86 
 
 		 445 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  34.86 
 
 		 445 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  34.86 
 
 		 445 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  34.86 
 
 		 445 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  34.62 
 
 		 445 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  34.29 
 
 		 444 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  34.29 
 
 		 444 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  34.29 
 
 		 444 aa  259  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  37.75 
 
 		 450 aa  252  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  34.39 
 
 		 451 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  34.62 
 
 		 451 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2759  lysine/cadaverine antiporter  32.58 
 
 		 443 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2800  lysine/cadaverine antiporter  32.58 
 
 		 443 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.1623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2934  lysine/cadaverine antiporter  32.58 
 
 		 443 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.252343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2821  lysine/cadaverine antiporter  32.58 
 
 		 443 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2717  lysine/cadaverine antiporter  32.58 
 
 		 443 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00206  lysine/cadaverine antiporter  35.77 
 
 		 448 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002188  lysine/cadaverine antiporter membrane protein CadB  35.77 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000189693  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2657  lysine/cadaverine antiporter  36.59 
 
 		 445 aa  220  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1006  lysine/cadaverine antiporter  34.84 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000705878  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2492  lysine/cadaverine antiporter  35.5 
 
 		 444 aa  216  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3768  lysine/cadaverine antiporter  33.81 
 
 		 449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000519797  normal  0.028767 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04003  predicted lysine/cadaverine transporter  34.53 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4373  lysine/cadaverine antiporter  34.53 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0915774  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4601  lysine/cadaverine antiporter  34.53 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000619747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5648  lysine/cadaverine antiporter  34.53 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.742778  normal  0.745814 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4687  lysine/cadaverine antiporter  34.53 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03965  hypothetical protein  34.53 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3895  lysine/cadaverine antiporter  34.53 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 		 445 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  32.16 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4244  amino acid permease-associated region  31.24 
 
 		 453 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 441 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  29.08 
 
 		 476 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  31 
 
 		 440 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  29.73 
 
 		 411 aa  167  5e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  30.99 
 
 		 460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 436 aa  163  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  29.9 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 452 aa  156  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1674  phospholipid binding protein  28.92 
 
 		 438 aa  133  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.054806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0755  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 474 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.254398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0901  amino acid permease family protein  28.18 
 
 		 474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.264525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4436  amino acid permease family protein  27.44 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0280359  normal  0.0537632 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1029  amino acid permease family protein  27.44 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.530326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0754  arginine/ornithine antiporter  27.44 
 
 		 474 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0749  arginine/ornithine antiporter  27.08 
 
 		 474 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000982146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0941  amino acid permease family protein  27.23 
 
 		 474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000289126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0937  amino acid permease family protein  27.23 
 
 		 474 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0683  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 		 471 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>