More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0252 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 485 aa  962    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  56.06 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  42.51 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  42.67 
 
 		 484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  36.57 
 
 		 483 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  38.51 
 
 		 484 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  42.46 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  35.73 
 
 		 479 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  35.73 
 
 		 479 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  36.55 
 
 		 509 aa  266  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  36.14 
 
 		 510 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  33.8 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  37.11 
 
 		 485 aa  254  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  37.38 
 
 		 509 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  34.73 
 
 		 467 aa  250  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  35.31 
 
 		 495 aa  249  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  38.13 
 
 		 490 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  36.57 
 
 		 516 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  39.17 
 
 		 497 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  37.32 
 
 		 491 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  35.07 
 
 		 510 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  35.07 
 
 		 510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  35.07 
 
 		 510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  37.45 
 
 		 496 aa  240  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  33.57 
 
 		 464 aa  237  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  36.45 
 
 		 510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  35.6 
 
 		 513 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  38.17 
 
 		 486 aa  229  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  34.69 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  38.86 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  34.15 
 
 		 485 aa  217  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  37.8 
 
 		 483 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  34.33 
 
 		 502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  34.38 
 
 		 516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  34.18 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  32.2 
 
 		 527 aa  196  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  30 
 
 		 481 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  32.08 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  29 
 
 		 487 aa  189  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 486 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  32.58 
 
 		 504 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  32.34 
 
 		 507 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 475 aa  104  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 511 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 491 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 502 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 502 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 507 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 461 aa  87.4  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  28.08 
 
 		 492 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  28.08 
 
 		 492 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  28.08 
 
 		 492 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  24.58 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 497 aa  84  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1182  amino acid permease-associated region  24.58 
 
 		 472 aa  80.9  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.616059 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 490 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  28.93 
 
 		 716 aa  76.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  24.3 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 506 aa  75.1  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 		 521 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 		 462 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  25.66 
 
 		 468 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  24.86 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  24.15 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  27.91 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  32.19 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  23.91 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.15 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  27.56 
 
 		 486 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 450 aa  69.7  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  23.96 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  22.93 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  29.3 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  23.08 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  27.84 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  23.86 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  27.84 
 
 		 470 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 473 aa  67  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  27.84 
 
 		 470 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  22.49 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  22.62 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  24.92 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  21.75 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  24.76 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  23.65 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  24.76 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  30.12 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  22.84 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  25.93 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>