More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1660 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  920    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  99.57 
 
 
464 aa  918    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  51.45 
 
 
476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  51.45 
 
 
470 aa  447  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  47.41 
 
 
467 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  47.41 
 
 
467 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  42.06 
 
 
474 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  42.06 
 
 
474 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  41.26 
 
 
474 aa  355  1e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  42.23 
 
 
466 aa  347  2e-94  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  40.13 
 
 
494 aa  336  7e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  35.89 
 
 
495 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  35.54 
 
 
469 aa  320  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  41.04 
 
 
473 aa  317  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  35.79 
 
 
473 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  38.38 
 
 
508 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  39.1 
 
 
475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  36.14 
 
 
480 aa  307  3e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  37.56 
 
 
475 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  40.8 
 
 
473 aa  306  6e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  35.97 
 
 
499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  34.66 
 
 
506 aa  289  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  35.15 
 
 
506 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  35.93 
 
 
495 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  33.57 
 
 
490 aa  266  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  31.41 
 
 
473 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  31.41 
 
 
473 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  31.41 
 
 
473 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  31.41 
 
 
473 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  31.41 
 
 
473 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  31.09 
 
 
472 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  30.52 
 
 
511 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  30.52 
 
 
511 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.52 
 
 
511 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  30.52 
 
 
511 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  30.52 
 
 
511 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.52 
 
 
511 aa  224  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.52 
 
 
511 aa  224  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.52 
 
 
511 aa  224  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  30.74 
 
 
472 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.52 
 
 
511 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  30.61 
 
 
485 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  29.67 
 
 
485 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  33.63 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  36.29 
 
 
445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  29.43 
 
 
503 aa  207  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  31.26 
 
 
720 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  30.16 
 
 
511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 
464 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  26.87 
 
 
472 aa  156  8e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  28.34 
 
 
455 aa  149  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  26.24 
 
 
494 aa  146  9e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  26.53 
 
 
467 aa  143  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  28.73 
 
 
476 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 
481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  24.82 
 
 
465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 
500 aa  130  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 
497 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 
500 aa  124  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  25.23 
 
 
495 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  25.23 
 
 
495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  25.59 
 
 
489 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  25.35 
 
 
489 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  28.45 
 
 
445 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  27.78 
 
 
445 aa  97.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  27.78 
 
 
445 aa  97.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  27.78 
 
 
445 aa  97.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  27.78 
 
 
445 aa  97.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  27.03 
 
 
445 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  27.03 
 
 
445 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 
445 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  27.03 
 
 
445 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  27.03 
 
 
445 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  27.03 
 
 
445 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  27.03 
 
 
445 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  27.03 
 
 
445 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  27.11 
 
 
445 aa  94.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  27.3 
 
 
446 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  28.9 
 
 
463 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  28.14 
 
 
444 aa  90.9  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  28.14 
 
 
444 aa  90.9  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  28.14 
 
 
444 aa  90.5  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1880  amino acid transporter  22.78 
 
 
492 aa  87.8  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000114764  hitchhiker  0.000000000709791 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 
471 aa  87.4  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  24.79 
 
 
471 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  27.76 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1975  amino acid permease-associated region  23.59 
 
 
496 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0217  amino acid antiporter  26.56 
 
 
782 aa  85.1  0.000000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  25.86 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2101  arginine/ornithine antiporter  26.27 
 
 
475 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0476819  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 
481 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5194  putrescine transporter  25.71 
 
 
452 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  24.58 
 
 
471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 
503 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0976  amino acid permease family protein  24.94 
 
 
540 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.953218  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 
438 aa  83.6  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1005  amino acid permease family protein  24.94 
 
 
540 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  25.86 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.78 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.36 
 
 
471 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>