More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1747 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  92.16 
 
 		 509 aa  871    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 510 aa  977    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  57.88 
 
 		 490 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  48.88 
 
 		 502 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  46.56 
 
 		 495 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  50 
 
 		 504 aa  363  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  43.94 
 
 		 509 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  49.27 
 
 		 507 aa  332  9e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  37.01 
 
 		 479 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  37.01 
 
 		 479 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  37.78 
 
 		 485 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  34.58 
 
 		 483 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  37.11 
 
 		 484 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  36.73 
 
 		 484 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  36.14 
 
 		 485 aa  261  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  35.96 
 
 		 516 aa  256  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  36.56 
 
 		 485 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  38.2 
 
 		 488 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  40.18 
 
 		 486 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  34.26 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  34.92 
 
 		 464 aa  240  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  39.27 
 
 		 497 aa  237  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  33.96 
 
 		 481 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  36.42 
 
 		 497 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  36.6 
 
 		 491 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  33.82 
 
 		 487 aa  228  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  34.02 
 
 		 486 aa  224  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  39.79 
 
 		 483 aa  219  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  37.61 
 
 		 496 aa  216  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  32.08 
 
 		 493 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  34.67 
 
 		 492 aa  210  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  30.69 
 
 		 504 aa  210  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  33.97 
 
 		 485 aa  209  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  34.19 
 
 		 498 aa  201  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 		 510 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  30.91 
 
 		 510 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  30.91 
 
 		 510 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  30.91 
 
 		 510 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 		 516 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  28.22 
 
 		 513 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  30.51 
 
 		 474 aa  177  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  29.51 
 
 		 527 aa  163  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 491 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 521 aa  94  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 		 457 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  27.89 
 
 		 475 aa  91.7  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 490 aa  90.1  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 469 aa  89.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 497 aa  88.6  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 487 aa  88.2  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 462 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 462 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 462 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 		 492 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 		 492 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 		 454 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  27.99 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 501 aa  84  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  24.19 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  28.68 
 
 		 489 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  28.53 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  29.59 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 		 507 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  24.49 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  27.39 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3130  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  24.39 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 511 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 		 502 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  27.27 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  27.59 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  25.74 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  23.02 
 
 		 465 aa  74.3  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 		 450 aa  73.2  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1860  putative transporter  28.76 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  27.04 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  23.99 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  28.22 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  24.38 
 
 		 450 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>