More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3067 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 498 aa  956    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  49.42 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  46.78 
 
 		 485 aa  378  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  43.41 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  50.23 
 
 		 486 aa  344  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  46.65 
 
 		 492 aa  321  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  41.13 
 
 		 484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  46.26 
 
 		 497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  38.63 
 
 		 467 aa  294  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  39.41 
 
 		 509 aa  291  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  37.72 
 
 		 479 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  37.72 
 
 		 479 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  38.09 
 
 		 484 aa  284  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  40.89 
 
 		 464 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  38.83 
 
 		 516 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  40.89 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  38.46 
 
 		 495 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  46.74 
 
 		 483 aa  277  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  38.43 
 
 		 488 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  36.66 
 
 		 493 aa  267  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  41.5 
 
 		 496 aa  266  8e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  36.53 
 
 		 485 aa  265  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  35.17 
 
 		 487 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  33.74 
 
 		 485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  40.92 
 
 		 497 aa  253  6e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  36.67 
 
 		 509 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  34.03 
 
 		 504 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  36.11 
 
 		 510 aa  247  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  34.74 
 
 		 481 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  32.93 
 
 		 510 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  32.93 
 
 		 510 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 513 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  34.4 
 
 		 510 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  34.81 
 
 		 486 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  32.57 
 
 		 510 aa  229  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  33.71 
 
 		 516 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  33.9 
 
 		 490 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  33.49 
 
 		 474 aa  210  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  32.35 
 
 		 527 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  29.39 
 
 		 502 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  33.48 
 
 		 504 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  32.19 
 
 		 507 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 		 491 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 475 aa  92  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 486 aa  90.5  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 521 aa  90.1  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 459 aa  89.4  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 		 487 aa  86.3  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  26.33 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  25.67 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  24.93 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  25.63 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  26.05 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  24.66 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  25.11 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  29.97 
 
 		 506 aa  72.8  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  24.82 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  22.75 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  25.34 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  25.52 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  25.34 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  24.88 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  25.34 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  23.06 
 
 		 442 aa  69.7  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  25.11 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 482 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  23.89 
 
 		 506 aa  69.7  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 477 aa  70.1  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  24.93 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  23.2 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  25.23 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  28.46 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  24.17 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00777  putative cationic amino acid transport protein  27.92 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  24.25 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  24.25 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  24.25 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>