More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2478 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  100 
 
 
459 aa  892    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  55.61 
 
 
450 aa  496  1e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  30.51 
 
 
526 aa  168  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 
492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 
492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 
492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 
487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 
485 aa  107  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 
479 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 
479 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  29.19 
 
 
475 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 
454 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1984  amino acid permease-associated region  29.95 
 
 
468 aa  100  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 
504 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 
485 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 
493 aa  97.8  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  23.65 
 
 
486 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  23.04 
 
 
516 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  24.13 
 
 
510 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  24.13 
 
 
510 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 
483 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  23.48 
 
 
484 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  24.13 
 
 
510 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  23.91 
 
 
510 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 
487 aa  93.6  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  28.37 
 
 
461 aa  93.2  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 
467 aa  93.2  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 
513 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 
495 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 
462 aa  90.1  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 
506 aa  87.4  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  22.71 
 
 
434 aa  87  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 
501 aa  87  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 
492 aa  86.7  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 
497 aa  86.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 
464 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  22.58 
 
 
449 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 
527 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  24.75 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 
490 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1819  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 
474 aa  82  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  22.04 
 
 
449 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  25.21 
 
 
497 aa  81.3  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 
482 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 
463 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 
484 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  25.37 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  25.49 
 
 
509 aa  80.5  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 
506 aa  79.7  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 
463 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  31.21 
 
 
498 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  23.51 
 
 
510 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 
474 aa  79.7  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 
450 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 
486 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1492  amino acid transporter  25.23 
 
 
447 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.0000000000000168224 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  24.36 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 
491 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  26.23 
 
 
447 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  0.0000000124915 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  23.1 
 
 
466 aa  77  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 
462 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 
462 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 
462 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1476  amino acid transporter  26.02 
 
 
447 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.161402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 
449 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1792  amino acid transporter  26.23 
 
 
447 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000593149  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  26.45 
 
 
488 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 
495 aa  75.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  25.09 
 
 
497 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 
469 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 
504 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1698  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 
463 aa  74.3  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.471872  normal  0.470522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  24.92 
 
 
468 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1963  amino acid transporter  25.96 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.041678  hitchhiker  0.00000000765672 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 
477 aa  73.6  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  27.86 
 
 
501 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0250  amino acid permease-associated region  27.86 
 
 
466 aa  72.4  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.4961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 
455 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  23.34 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  24.58 
 
 
465 aa  71.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 
486 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0872  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 
525 aa  70.1  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 
463 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 
468 aa  70.1  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  21.91 
 
 
443 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  21.66 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  21.66 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 
490 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  21.66 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 
455 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0924  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 
466 aa  68.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  22.09 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  27.3 
 
 
483 aa  67.8  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 
478 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  22.08 
 
 
450 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  22.08 
 
 
450 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 
453 aa  67  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  22.78 
 
 
454 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>