More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2078 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 527 aa  1039    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  49.81 
 
 		 510 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  51.15 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  49.81 
 
 		 510 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  49.81 
 
 		 510 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  50.37 
 
 		 510 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  49.51 
 
 		 516 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  48.09 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  44.91 
 
 		 504 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  37.19 
 
 		 484 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  32.41 
 
 		 479 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  32.41 
 
 		 479 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  31.59 
 
 		 483 aa  239  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  34.31 
 
 		 495 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  35.92 
 
 		 497 aa  226  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  32.06 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  33.06 
 
 		 516 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  33.52 
 
 		 484 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  34.02 
 
 		 485 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  33.02 
 
 		 488 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  32.77 
 
 		 485 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  32.68 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  30.71 
 
 		 464 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  34.15 
 
 		 497 aa  194  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  30.48 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  33.14 
 
 		 485 aa  192  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  31.38 
 
 		 493 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  28.54 
 
 		 481 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  30.27 
 
 		 486 aa  177  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  30.59 
 
 		 492 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 		 485 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  33.33 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  32.67 
 
 		 498 aa  167  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  32.2 
 
 		 509 aa  166  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  30.24 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  29.9 
 
 		 510 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  30.67 
 
 		 496 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 		 490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  31.56 
 
 		 504 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 502 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  29.78 
 
 		 507 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  23.69 
 
 		 469 aa  101  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 		 501 aa  95.1  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 482 aa  93.6  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 507 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 475 aa  90.5  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 495 aa  88.2  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 492 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 492 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  22.24 
 
 		 490 aa  87  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  25.92 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  23.69 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 506 aa  84.7  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  30.23 
 
 		 506 aa  84  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 502 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 502 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  23.4 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  27.07 
 
 		 465 aa  73.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  23.37 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  24.39 
 
 		 553 aa  70.5  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  29.84 
 
 		 489 aa  67  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 		 466 aa  66.6  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  25 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 517 aa  66.6  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  25.78 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  29.31 
 
 		 527 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  21.55 
 
 		 521 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  22.31 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  26.99 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  22.96 
 
 		 486 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  22.88 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00777  putative cationic amino acid transport protein  28.1 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 440 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  28.12 
 
 		 486 aa  60.1  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  21.47 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  24.58 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  30.98 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  28.85 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>