More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3532 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  88.93 
 
 		 496 aa  832    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  88.89 
 
 		 492 aa  802    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  99.8 
 
 		 499 aa  986    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 499 aa  989    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  71.69 
 
 		 527 aa  672    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 539 aa  988    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  29.5 
 
 		 506 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  30.29 
 
 		 521 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  30.29 
 
 		 521 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  29.96 
 
 		 521 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  30.31 
 
 		 510 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  32.73 
 
 		 502 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  32.15 
 
 		 503 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  29.48 
 
 		 521 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 		 547 aa  177  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  32.14 
 
 		 513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  30.44 
 
 		 538 aa  167  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  31.39 
 
 		 531 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  34.63 
 
 		 519 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  30.69 
 
 		 527 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 528 aa  153  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  28.54 
 
 		 518 aa  152  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  29.36 
 
 		 514 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  28.35 
 
 		 519 aa  143  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 494 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.65 
 
 		 542 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 505 aa  136  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  30.58 
 
 		 562 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  26.61 
 
 		 510 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 510 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 530 aa  127  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 486 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 486 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 486 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 514 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  25.11 
 
 		 538 aa  122  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 522 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  26.67 
 
 		 544 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 505 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  28.81 
 
 		 497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  25.33 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 516 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 520 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 543 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  24.14 
 
 		 570 aa  110  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  25.44 
 
 		 570 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 515 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  25.52 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 483 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 483 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  27.63 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  23.47 
 
 		 526 aa  104  5e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  26.04 
 
 		 571 aa  103  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 487 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  26.64 
 
 		 514 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.88 
 
 		 532 aa  99.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  23.27 
 
 		 547 aa  99.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  26.12 
 
 		 496 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.05 
 
 		 527 aa  95.9  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 483 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 504 aa  93.6  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.8 
 
 		 532 aa  91.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  21.81 
 
 		 537 aa  84.7  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  23.91 
 
 		 502 aa  83.2  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  21.66 
 
 		 495 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 482 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 482 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  23.87 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  43.75 
 
 		 549 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  26.33 
 
 		 753 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.01 
 
 		 507 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  24.31 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  24.51 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  24.7 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  24.12 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  25.54 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.01 
 
 		 553 aa  76.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  25.85 
 
 		 764 aa  76.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 725 aa  75.5  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  25.11 
 
 		 518 aa  75.1  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  20.66 
 
 		 576 aa  75.1  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  24.13 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  25.84 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  28.39 
 
 		 466 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  26.6 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1773  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 		 497 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00284908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1739  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 		 497 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000499031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  26.6 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1245  amino acid permease family protein  25.24 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000163371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>