More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_64090 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  100 
 
 		 547 aa  1115    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  48.87 
 
 		 570 aa  506  9.999999999999999e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  42.8 
 
 		 544 aa  412  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  41.56 
 
 		 553 aa  329  7e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  31.83 
 
 		 526 aa  234  3e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  30.66 
 
 		 570 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  27.51 
 
 		 538 aa  191  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 		 528 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  28.79 
 
 		 519 aa  174  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  28.52 
 
 		 502 aa  173  9e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 514 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.76 
 
 		 542 aa  160  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  25.84 
 
 		 530 aa  146  9e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  23.84 
 
 		 571 aa  145  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  26.95 
 
 		 518 aa  144  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.96 
 
 		 532 aa  144  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  26.38 
 
 		 521 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 527 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  27.27 
 
 		 495 aa  137  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.54 
 
 		 507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.33 
 
 		 532 aa  133  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  26.59 
 
 		 539 aa  133  6.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 		 522 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  24.72 
 
 		 520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  24.17 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.52 
 
 		 527 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  23.53 
 
 		 514 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  24.39 
 
 		 526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  23.89 
 
 		 547 aa  114  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  23.89 
 
 		 542 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  23.66 
 
 		 516 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  22.31 
 
 		 576 aa  107  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  22.56 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  22.86 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  22.32 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 492 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 522 aa  98.6  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  24 
 
 		 510 aa  98.6  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 516 aa  98.6  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  23.84 
 
 		 530 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  23.84 
 
 		 510 aa  97.1  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 514 aa  97.1  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 499 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  22.6 
 
 		 515 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 496 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  25.24 
 
 		 523 aa  94.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 539 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 499 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  22.15 
 
 		 518 aa  91.3  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  24.86 
 
 		 527 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.34 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.83 
 
 		 517 aa  81.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08198  choline transporter, putative (Eurofung)  25.09 
 
 		 509 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.273035  normal  0.278378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  22.13 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  22.13 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  22.13 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  24.55 
 
 		 496 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.43 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 468 aa  72  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 		 505 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  25.39 
 
 		 468 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  24.69 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  22.06 
 
 		 503 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  20.85 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  20.78 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  24.82 
 
 		 496 aa  67  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 487 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  22.51 
 
 		 506 aa  64.3  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  22.63 
 
 		 521 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 770 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  33.58 
 
 		 517 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1487  amino acid transporter  23.05 
 
 		 452 aa  63.5  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.838437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  22.32 
 
 		 538 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  26.07 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  31.64 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  21.6 
 
 		 506 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 482 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  31.28 
 
 		 476 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  31.93 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 		 745 aa  60.1  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  25.56 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 513 aa  59.3  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2130  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 643 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.345831  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  30.45 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 562 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  25.37 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  25.37 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0966577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>