114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30629 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  100 
 
 		 526 aa  1060    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  30.12 
 
 		 514 aa  226  6e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  30.1 
 
 		 571 aa  226  1e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  30.14 
 
 		 576 aa  219  1e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  28.46 
 
 		 495 aa  217  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  30.36 
 
 		 518 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  30.19 
 
 		 539 aa  209  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.31 
 
 		 532 aa  199  9e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  28.38 
 
 		 516 aa  197  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  25.79 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  29.38 
 
 		 507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  28.13 
 
 		 518 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  24.2 
 
 		 526 aa  177  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.45 
 
 		 532 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  29.94 
 
 		 520 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  27.22 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.36 
 
 		 542 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.58 
 
 		 517 aa  151  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 514 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  27.58 
 
 		 547 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.14 
 
 		 527 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  25.91 
 
 		 537 aa  134  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  24.22 
 
 		 542 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  26.18 
 
 		 764 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  25.29 
 
 		 570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.8 
 
 		 499 aa  121  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  25 
 
 		 553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  23.37 
 
 		 570 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.65 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475155 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  22.93 
 
 		 528 aa  107  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  24.24 
 
 		 544 aa  106  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  24.76 
 
 		 547 aa  106  9e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  22.88 
 
 		 519 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  24.1 
 
 		 502 aa  99.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  22.56 
 
 		 486 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  22.56 
 
 		 486 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  22.56 
 
 		 486 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 		 516 aa  92  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  22.86 
 
 		 496 aa  88.6  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08198  choline transporter, putative (Eurofung)  25.36 
 
 		 509 aa  87.4  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.273035  normal  0.278378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  23.08 
 
 		 521 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 514 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  20.87 
 
 		 538 aa  81.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  24.06 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  22.78 
 
 		 521 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  22.78 
 
 		 521 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  23.17 
 
 		 530 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  22.54 
 
 		 521 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  23.93 
 
 		 506 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  23.31 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  21.63 
 
 		 505 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  22.46 
 
 		 487 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  22.25 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  22.25 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  23.01 
 
 		 527 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  23.26 
 
 		 522 aa  66.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01702  conserved hypothetical protein  30.53 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0232307  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  19.19 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  21.77 
 
 		 492 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  21.99 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  22.37 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 		 499 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  24.74 
 
 		 522 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  23.8 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  23.45 
 
 		 538 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  24.58 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  19.08 
 
 		 506 aa  57  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 562 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  25.51 
 
 		 513 aa  56.6  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 549 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 		 503 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  22.68 
 
 		 497 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  21.86 
 
 		 523 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  23 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  20.65 
 
 		 510 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  19.09 
 
 		 527 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  17.89 
 
 		 505 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  20 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  22.66 
 
 		 576 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 463 aa  48.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 491 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  23.23 
 
 		 544 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  22.87 
 
 		 530 aa  48.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  24.52 
 
 		 461 aa  47.8  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1301  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 		 534 aa  47.4  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.259093  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 474 aa  47  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  23.29 
 
 		 547 aa  45.8  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  23.46 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  23.46 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  23.46 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  23.46 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  23.46 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  23.59 
 
 		 470 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  24.21 
 
 		 479 aa  44.3  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  23.78 
 
 		 470 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>