237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_10972 on replicon BN001304
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  100 
 
 
516 aa  1044    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.815116 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  43.87 
 
 
516 aa  419  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  34.08 
 
 
571 aa  291  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  35.74 
 
 
539 aa  286  7e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  32.93 
 
 
576 aa  261  1e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  32.85 
 
 
520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  32.03 
 
 
542 aa  232  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  29.55 
 
 
518 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  29.27 
 
 
514 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.538203 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  30.37 
 
 
495 aa  209  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  29.28 
 
 
530 aa  205  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  29.08 
 
 
532 aa  197  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  27.89 
 
 
518 aa  197  5.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.7 
 
 
532 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  28.34 
 
 
537 aa  173  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.61 
 
 
527 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.94 
 
 
499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  25 
 
 
542 aa  164  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  27.22 
 
 
526 aa  164  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.63 
 
 
507 aa  158  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  27.67 
 
 
547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  25.34 
 
 
526 aa  139  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 
514 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.79 
 
 
442 aa  136  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475155 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  25.05 
 
 
519 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.171098 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  23.03 
 
 
570 aa  129  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 
528 aa  121  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08198  choline transporter, putative (Eurofung)  28.95 
 
 
509 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.273035  normal  0.278378 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  24.29 
 
 
544 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.39 
 
 
517 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  24.95 
 
 
538 aa  105  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  23.46 
 
 
547 aa  103  9e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  22.99 
 
 
502 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  22.43 
 
 
570 aa  97.1  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 
514 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 
506 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  25.57 
 
 
764 aa  91.7  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 
510 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  23.98 
 
 
510 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  22.94 
 
 
521 aa  88.2  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 
515 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  22.33 
 
 
530 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  27.61 
 
 
523 aa  83.6  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.06 
 
 
553 aa  82.4  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 
521 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  22.83 
 
 
506 aa  80.5  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  23.03 
 
 
543 aa  80.1  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 
521 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 
521 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 
520 aa  74.7  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  22.52 
 
 
505 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 
502 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 
494 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 
496 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 
492 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  21.26 
 
 
516 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 
522 aa  68.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  23.34 
 
 
496 aa  67  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 
562 aa  67.4  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 
539 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 
499 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 
499 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  22.59 
 
 
527 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 
538 aa  64.3  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  32 
 
 
510 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  21.62 
 
 
522 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  23.66 
 
 
725 aa  60.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  23.5 
 
 
519 aa  60.1  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  22.01 
 
 
547 aa  58.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  21.41 
 
 
440 aa  58.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  24.31 
 
 
527 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 
486 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 
486 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 
486 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  23.93 
 
 
520 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  23.35 
 
 
487 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  22.16 
 
 
441 aa  57  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 
455 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  22.72 
 
 
468 aa  55.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  23.58 
 
 
483 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  23.58 
 
 
483 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  23.68 
 
 
486 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  22.98 
 
 
440 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 
455 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 
549 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  25.06 
 
 
469 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  25.37 
 
 
471 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  24.04 
 
 
467 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  29.86 
 
 
510 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  29.86 
 
 
510 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  21.98 
 
 
503 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  29.86 
 
 
510 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  22.7 
 
 
447 aa  52.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  25 
 
 
471 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  26.32 
 
 
473 aa  52  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  23.6 
 
 
482 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  22.45 
 
 
440 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  31.88 
 
 
464 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  24.3 
 
 
466 aa  51.6  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 
513 aa  52  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>