216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA05590 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  100 
 
 		 764 aa  1562    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 528 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  27 
 
 		 519 aa  143  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 		 530 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 		 510 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  26.45 
 
 		 576 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  26.18 
 
 		 526 aa  127  6e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  25.9 
 
 		 510 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 514 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  24.44 
 
 		 526 aa  114  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  25.53 
 
 		 495 aa  114  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 		 516 aa  112  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.42 
 
 		 517 aa  109  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  25.88 
 
 		 520 aa  108  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  23.98 
 
 		 571 aa  105  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  26.03 
 
 		 521 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 522 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  23.42 
 
 		 516 aa  101  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  22.7 
 
 		 514 aa  100  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 		 543 aa  100  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.41 
 
 		 507 aa  99.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  23.24 
 
 		 518 aa  99  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 515 aa  97.8  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  25.92 
 
 		 514 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  25.7 
 
 		 542 aa  96.3  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  24.22 
 
 		 530 aa  96.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 522 aa  92  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  25.57 
 
 		 516 aa  92  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 		 506 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  24.23 
 
 		 539 aa  87.8  6e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 		 520 aa  87.4  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  24.63 
 
 		 527 aa  85.9  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  24.44 
 
 		 523 aa  84.7  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  22.31 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  21.53 
 
 		 570 aa  84  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 506 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.81 
 
 		 532 aa  82  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  23.31 
 
 		 518 aa  81.6  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  28.01 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  22.56 
 
 		 521 aa  80.9  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  23.37 
 
 		 547 aa  80.1  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  22.5 
 
 		 570 aa  78.6  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  22.76 
 
 		 521 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  22.76 
 
 		 521 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  24.56 
 
 		 505 aa  77.4  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  22.61 
 
 		 502 aa  76.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  22.88 
 
 		 537 aa  75.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  22.7 
 
 		 542 aa  75.9  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  23.22 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  21.02 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  22.76 
 
 		 527 aa  74.7  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  21.56 
 
 		 544 aa  72.8  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  23.68 
 
 		 513 aa  73.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.22 
 
 		 553 aa  71.2  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.97 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475155 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05678  amino acid transporter (Eurofung)  24 
 
 		 588 aa  67.4  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561321  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  22.14 
 
 		 547 aa  67  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0393  lysine-specific permease  23.22 
 
 		 492 aa  66.6  0.000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.449766  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  22.09 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  22.09 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  22.09 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  22.68 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  23.26 
 
 		 538 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  23.11 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  23.11 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  23.11 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02468  amino acid transporter (Eurofung)  22.8 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  23.49 
 
 		 441 aa  57  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00270  amino acid transporter, putative  25.24 
 
 		 572 aa  56.6  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102961  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  23.84 
 
 		 487 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 499 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  24.77 
 
 		 489 aa  56.2  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  23.88 
 
 		 489 aa  55.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08198  choline transporter, putative (Eurofung)  24.57 
 
 		 509 aa  55.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.273035  normal  0.278378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  24 
 
 		 549 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 510 aa  55.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 		 499 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  23.47 
 
 		 487 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  22.17 
 
 		 505 aa  55.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  22.19 
 
 		 455 aa  54.7  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  22.85 
 
 		 493 aa  54.7  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 468 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2563  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 461 aa  54.3  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.239027  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  24.25 
 
 		 468 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 449 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1821  lysine-specific permease  22.86 
 
 		 489 aa  52.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  24.25 
 
 		 468 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 716 aa  52.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  24.66 
 
 		 470 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 		 531 aa  52.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 473 aa  52.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  25.1 
 
 		 740 aa  52  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 496 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  24.47 
 
 		 473 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  21.47 
 
 		 450 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65850  amino acid ABC transporter permease  24.12 
 
 		 470 aa  52  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397279  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  24.47 
 
 		 473 aa  51.6  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  24.47 
 
 		 473 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  24.47 
 
 		 473 aa  51.2  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>