More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE00270 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006682  CNM00800  amino acid transporter, putative  81.75 
 
 		 575 aa  961    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00270  amino acid transporter, putative  100 
 
 		 572 aa  1154    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102961  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02430  amino acid transporter, putative  51.69 
 
 		 548 aa  489  1e-137  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.297208  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05800  amino acid transporter, putative  43.92 
 
 		 563 aa  439  9.999999999999999e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05678  amino acid transporter (Eurofung)  41.89 
 
 		 588 aa  422  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561321  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06118  Amino acid transporter Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2M1L6]  41.03 
 
 		 567 aa  415  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.889854  normal  0.0238018 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82860  dicarboxylic amino acid permease  39.85 
 
 		 583 aa  397  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.916689  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01581  proline transporter (Eurofung)  42.86 
 
 		 519 aa  393  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0103942 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52197  Proline specific permease  40.98 
 
 		 574 aa  391  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0650572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81453  general amino acid permease  41.98 
 
 		 589 aa  386  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0498735 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32180  general amino acid permease  41.57 
 
 		 554 aa  381  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.279338  normal  0.0497012 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30939  arginine permease  40.28 
 
 		 552 aa  380  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0328856  normal  0.365315 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08279  basic amino acid transporter (Eurofung)  38.84 
 
 		 527 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84246  arginine permease  38.17 
 
 		 569 aa  374  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.385569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68755  general amino acid permease  40.48 
 
 		 599 aa  370  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37009  general amino acid permease  37.5 
 
 		 579 aa  366  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.367656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  39.19 
 
 		 490 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  40.24 
 
 		 526 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2247  amino acid permease-associated region  40.63 
 
 		 496 aa  364  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04328  amino acid transporter (Eurofung)  35.26 
 
 		 581 aa  361  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4318  amino acid permease-associated region  39.44 
 
 		 493 aa  361  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.193493  normal  0.498738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  40.43 
 
 		 527 aa  361  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  40.16 
 
 		 520 aa  360  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  40.16 
 
 		 520 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  40.16 
 
 		 520 aa  360  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  40.16 
 
 		 520 aa  360  4e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  40.16 
 
 		 520 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  40.16 
 
 		 520 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  38.9 
 
 		 526 aa  359  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  41.21 
 
 		 487 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  40.36 
 
 		 520 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  41.41 
 
 		 487 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  38.9 
 
 		 526 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04649  amino acid transporter (Eurofung)  38.45 
 
 		 553 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.410395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  40.04 
 
 		 526 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  40.04 
 
 		 526 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  40.12 
 
 		 514 aa  356  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  39.72 
 
 		 526 aa  355  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2396  amino acid transporter  39.84 
 
 		 511 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 538 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 538 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 511 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  39.64 
 
 		 536 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39044  dicarboxylic amino acid permease  37.04 
 
 		 519 aa  351  3e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.115951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  39.44 
 
 		 511 aa  350  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  36.71 
 
 		 503 aa  349  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  36.71 
 
 		 503 aa  349  7e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  36.71 
 
 		 503 aa  349  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1821  lysine-specific permease  40.12 
 
 		 489 aa  349  7e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  38.19 
 
 		 489 aa  348  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  38.4 
 
 		 489 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  38.4 
 
 		 489 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  38.4 
 
 		 489 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  38.4 
 
 		 489 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  38.4 
 
 		 489 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  40.41 
 
 		 479 aa  346  7e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1658  lysine transporter  37.68 
 
 		 491 aa  346  8e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271465  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1929  lysine transporter  37.47 
 
 		 491 aa  345  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.148093  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  38.13 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  38.13 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78721  amino acid permease  37.22 
 
 		 597 aa  345  2e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00834318 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  38.13 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  38.13 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  38.13 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  38.13 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  38.13 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  38.13 
 
 		 489 aa  345  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  38.13 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03287  amino acid transporter (Eurofung)  35.74 
 
 		 562 aa  343  4e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836736  hitchhiker  0.00261923 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02468  amino acid transporter (Eurofung)  39.38 
 
 		 533 aa  343  4e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4928  lysine-specific permease  38.1 
 
 		 510 aa  343  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.382341  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  37.17 
 
 		 493 aa  342  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1489  amino acid permease-associated region  38.77 
 
 		 511 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00379868  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  36.99 
 
 		 488 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  38.99 
 
 		 512 aa  340  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  40.87 
 
 		 500 aa  340  4e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1448  amino acid permease-associated region  38.77 
 
 		 511 aa  340  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0115525  hitchhiker  0.00101809 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57189  Proline-specific permease (Proline transport protein)  38.8 
 
 		 570 aa  340  5e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01732  Proline-specific permease (Proline transport protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P18696]  37.23 
 
 		 552 aa  339  9e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.839394  decreased coverage  0.00801022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2323  lysine transporter  36.87 
 
 		 492 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2418  lysine transporter  37.5 
 
 		 490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  36.31 
 
 		 488 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  36.51 
 
 		 488 aa  337  5e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  36.31 
 
 		 488 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3839  amino acid permease-associated region  39.24 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.301841 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  36.11 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  36.11 
 
 		 488 aa  335  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  36.11 
 
 		 488 aa  335  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  36.11 
 
 		 488 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28502  amino acid permease  38.65 
 
 		 560 aa  334  3e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.545283  normal  0.640618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2141  amino acid transporter  38.86 
 
 		 510 aa  334  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.109603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  35.9 
 
 		 488 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51094  dicarboxylic amino acid permease  35.92 
 
 		 519 aa  333  4e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.31766  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02201  amino acid transporter (Eurofung)  36.71 
 
 		 544 aa  332  1e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000058324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1773  amino acid permease-associated region  37.75 
 
 		 497 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00284908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  35.9 
 
 		 488 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1739  amino acid permease-associated region  37.75 
 
 		 497 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000499031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  35.7 
 
 		 488 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29107  histidine permease  35.91 
 
 		 529 aa  331  2e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0754466 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3322  amino acid permease-associated region  39.29 
 
 		 511 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.427023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>