More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2463 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  86.41 
 
 		 506 aa  898    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  98.46 
 
 		 521 aa  1028    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 521 aa  1041    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 521 aa  1041    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  59.92 
 
 		 538 aa  578  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  57.99 
 
 		 562 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  49.12 
 
 		 513 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  47.3 
 
 		 503 aa  398  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  46.03 
 
 		 519 aa  356  5e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  42.72 
 
 		 531 aa  344  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  43.33 
 
 		 549 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  31.69 
 
 		 505 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  31 
 
 		 494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  31.16 
 
 		 506 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  30.41 
 
 		 547 aa  190  7e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  29.66 
 
 		 527 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 505 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  30.34 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  30.34 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  30.34 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  29.86 
 
 		 496 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  30.49 
 
 		 499 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  30.29 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  30.29 
 
 		 539 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  30.69 
 
 		 496 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 		 502 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  29.76 
 
 		 510 aa  170  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 		 492 aa  169  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  28.88 
 
 		 519 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 497 aa  147  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 483 aa  146  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  26.23 
 
 		 521 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  29.05 
 
 		 483 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 504 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 		 527 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  28.32 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  23.55 
 
 		 515 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 543 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 514 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  24.7 
 
 		 520 aa  124  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  24.21 
 
 		 523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 510 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  30.39 
 
 		 516 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  26.52 
 
 		 510 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 514 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  24.71 
 
 		 526 aa  114  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  24.79 
 
 		 530 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 522 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  24.25 
 
 		 539 aa  104  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.76 
 
 		 507 aa  98.6  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  29.66 
 
 		 525 aa  97.8  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  24.75 
 
 		 518 aa  95.5  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 497 aa  93.2  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.35 
 
 		 542 aa  92.8  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  23.36 
 
 		 514 aa  92.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  23.52 
 
 		 571 aa  92  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  28.73 
 
 		 447 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  26.43 
 
 		 467 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  28.43 
 
 		 471 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.58 
 
 		 467 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.58 
 
 		 467 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  28.44 
 
 		 455 aa  90.5  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.43 
 
 		 467 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.43 
 
 		 467 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.23 
 
 		 467 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.23 
 
 		 467 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  22.42 
 
 		 532 aa  88.2  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  23.35 
 
 		 547 aa  88.2  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.23 
 
 		 467 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.23 
 
 		 467 aa  87.4  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 440 aa  87.4  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 454 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 467 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  28.88 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 539 aa  84.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 		 506 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  29.46 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  27.41 
 
 		 576 aa  84  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 466 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  28.34 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  27.54 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 518 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  28.34 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  28.73 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.17 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  29.67 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.45 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.45 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>