More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1845 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  71.37 
 
 		 506 aa  695    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 505 aa  1004    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  59.54 
 
 		 494 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  35.88 
 
 		 547 aa  282  9e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  36.76 
 
 		 486 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  36.76 
 
 		 486 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  36.76 
 
 		 486 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  35.4 
 
 		 505 aa  259  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  33.47 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  31.61 
 
 		 504 aa  243  5e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  35.43 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  33.63 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  33.63 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  33.86 
 
 		 487 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  34.22 
 
 		 483 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  31.21 
 
 		 521 aa  223  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  31.69 
 
 		 521 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  31.69 
 
 		 521 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  34.52 
 
 		 483 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  30.99 
 
 		 506 aa  217  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  29.7 
 
 		 538 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  29.31 
 
 		 513 aa  196  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 549 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 531 aa  169  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  28.88 
 
 		 519 aa  166  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  29.66 
 
 		 562 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 502 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 		 527 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 		 528 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  27.17 
 
 		 521 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  25.8 
 
 		 519 aa  152  8.999999999999999e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 514 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 522 aa  150  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 		 510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  27 
 
 		 527 aa  140  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  27.09 
 
 		 510 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  28.54 
 
 		 518 aa  124  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 530 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  26.98 
 
 		 516 aa  121  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  23.64 
 
 		 514 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.54 
 
 		 542 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  24.95 
 
 		 496 aa  118  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  23.48 
 
 		 543 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  26.64 
 
 		 499 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  25.88 
 
 		 530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  24.27 
 
 		 523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 522 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 539 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 499 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  23.14 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  23.36 
 
 		 537 aa  101  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  22.39 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  20.72 
 
 		 532 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  24.89 
 
 		 570 aa  100  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.38 
 
 		 532 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  24.79 
 
 		 526 aa  95.1  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  25.6 
 
 		 520 aa  93.6  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  22.8 
 
 		 571 aa  92.4  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  24.55 
 
 		 538 aa  91.7  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  22.95 
 
 		 547 aa  91.7  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  23.47 
 
 		 443 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  22.04 
 
 		 507 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  23.73 
 
 		 455 aa  88.6  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  24.55 
 
 		 434 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  22.94 
 
 		 514 aa  87.4  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  25.52 
 
 		 544 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  21.87 
 
 		 539 aa  85.1  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  26.83 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  22.41 
 
 		 527 aa  84.3  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.37 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  24.3 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  21.85 
 
 		 502 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  23.25 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  23.82 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  25.93 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  22.94 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  23.8 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  23.57 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  23.57 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  23.57 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  23.57 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  23.57 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  23.57 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  23.57 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  23.33 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  25.21 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  24.56 
 
 		 764 aa  77.4  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  23.23 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>