117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE01030 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  100 
 
 		 576 aa  1167    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  53.46 
 
 		 520 aa  468  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  35.67 
 
 		 571 aa  305  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  33.72 
 
 		 532 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  31.79 
 
 		 516 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  36.42 
 
 		 530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  34.62 
 
 		 514 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  31.93 
 
 		 518 aa  252  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  32.93 
 
 		 516 aa  251  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  32.34 
 
 		 495 aa  251  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  30.62 
 
 		 542 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  32.2 
 
 		 539 aa  239  1e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  31.88 
 
 		 542 aa  234  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  29.85 
 
 		 532 aa  230  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  30.14 
 
 		 526 aa  219  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  31.19 
 
 		 518 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  32.29 
 
 		 526 aa  213  5.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  30.32 
 
 		 514 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  31.45 
 
 		 519 aa  206  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  33.5 
 
 		 507 aa  205  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  29.68 
 
 		 527 aa  204  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  28.45 
 
 		 547 aa  187  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  25.64 
 
 		 537 aa  183  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.15 
 
 		 499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  25 
 
 		 570 aa  174  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  28.14 
 
 		 521 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  28.69 
 
 		 528 aa  161  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  27.46 
 
 		 570 aa  156  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 514 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.57 
 
 		 517 aa  151  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  24.04 
 
 		 544 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  25.92 
 
 		 527 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  25.35 
 
 		 502 aa  135  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  26.45 
 
 		 764 aa  134  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.19 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08198  choline transporter, putative (Eurofung)  34.2 
 
 		 509 aa  127  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.273035  normal  0.278378 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  22.49 
 
 		 538 aa  119  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 515 aa  114  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  23.9 
 
 		 496 aa  113  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 530 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.29 
 
 		 553 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 510 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 		 543 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01702  conserved hypothetical protein  28.07 
 
 		 391 aa  108  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0232307  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  26.26 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  25.22 
 
 		 520 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  27.16 
 
 		 510 aa  103  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  22.41 
 
 		 547 aa  99.4  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 		 522 aa  90.5  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 506 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 538 aa  83.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 		 503 aa  80.9  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 516 aa  79.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  23.18 
 
 		 531 aa  78.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  24.58 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  23.37 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  23.01 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  23.13 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  23.4 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 549 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  23.26 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 486 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  23.51 
 
 		 483 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 486 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  23.51 
 
 		 483 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 486 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  21.61 
 
 		 496 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  23.78 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  21.41 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  23.28 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  21.41 
 
 		 499 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  21.41 
 
 		 499 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 562 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  24.18 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  23.53 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  20.92 
 
 		 527 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  21.68 
 
 		 505 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  24.79 
 
 		 519 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  22.1 
 
 		 495 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  24.56 
 
 		 527 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 497 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 440 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  25.96 
 
 		 461 aa  51.2  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  23.77 
 
 		 462 aa  50.8  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00270  amino acid transporter, putative  23.45 
 
 		 572 aa  50.4  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102961  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3036  amino acid transporter  24.1 
 
 		 464 aa  50.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0805799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  23.27 
 
 		 466 aa  50.4  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  23.02 
 
 		 439 aa  50.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  27.11 
 
 		 474 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  23.03 
 
 		 483 aa  47.4  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  24.87 
 
 		 483 aa  47  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 		 453 aa  46.6  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>