More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3666 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 503 aa  986    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  64.6 
 
 		 513 aa  588  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  63.14 
 
 		 519 aa  521  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  56.05 
 
 		 531 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  47.3 
 
 		 521 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  44.51 
 
 		 506 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  47.3 
 
 		 521 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  47.3 
 
 		 521 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  46.77 
 
 		 538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  53.04 
 
 		 549 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  46.34 
 
 		 562 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  31.95 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  32.44 
 
 		 547 aa  219  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 		 505 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 		 494 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 486 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 486 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 486 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  29.65 
 
 		 505 aa  172  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  33.56 
 
 		 527 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 510 aa  170  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  32.03 
 
 		 496 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  32.82 
 
 		 492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  30.6 
 
 		 502 aa  163  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  31.1 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  31.1 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  32.21 
 
 		 499 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  31.98 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  27.95 
 
 		 521 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  31.98 
 
 		 539 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  31.25 
 
 		 487 aa  156  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  28.05 
 
 		 519 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  29.27 
 
 		 497 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  30.7 
 
 		 496 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  29 
 
 		 504 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 		 527 aa  153  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 528 aa  150  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  30.14 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  30.4 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 522 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 514 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  27.11 
 
 		 523 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 514 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  26.86 
 
 		 510 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  27.24 
 
 		 530 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 		 520 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 543 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 516 aa  113  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  27.1 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.88 
 
 		 532 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  25.88 
 
 		 530 aa  107  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  25.3 
 
 		 514 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  24.17 
 
 		 538 aa  97.4  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  26.92 
 
 		 476 aa  96.7  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 454 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 		 440 aa  94.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.78 
 
 		 542 aa  93.6  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.32 
 
 		 532 aa  93.6  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  26.62 
 
 		 468 aa  93.6  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  24.54 
 
 		 570 aa  92  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  24.88 
 
 		 576 aa  90.9  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.79 
 
 		 507 aa  90.9  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 441 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 		 466 aa  90.1  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  24.61 
 
 		 526 aa  90.1  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  24.52 
 
 		 518 aa  89.7  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  25.62 
 
 		 468 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 468 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 468 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 450 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  26.71 
 
 		 547 aa  89  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  28.07 
 
 		 525 aa  89  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 468 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  29.26 
 
 		 489 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 440 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 486 aa  88.2  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  27.39 
 
 		 486 aa  88.6  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  23.69 
 
 		 443 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  23.69 
 
 		 443 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  23.69 
 
 		 443 aa  88.2  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 466 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  25.8 
 
 		 450 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  24.67 
 
 		 443 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 450 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  23.54 
 
 		 570 aa  87.4  6e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 454 aa  87  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 494 aa  86.7  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  27.15 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  27.15 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 500 aa  86.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  27.15 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  27.15 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  22.55 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  23.69 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  23.23 
 
 		 539 aa  85.1  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>