103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_04124 on replicon BN001302
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  100 
 
 
442 aa  879    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475155 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  38.64 
 
 
547 aa  291  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  38.74 
 
 
542 aa  260  4e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  36.59 
 
 
518 aa  243  5e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  36.15 
 
 
530 aa  239  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  30.91 
 
 
537 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  27.67 
 
 
571 aa  164  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  26.22 
 
 
495 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  28.35 
 
 
542 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  26.24 
 
 
514 aa  142  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.538203 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.23 
 
 
532 aa  139  8.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.68 
 
 
527 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  30.51 
 
 
514 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  28.79 
 
 
516 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  27.67 
 
 
519 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  24.19 
 
 
576 aa  129  8.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  26 
 
 
570 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.292579 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.88 
 
 
532 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  27.52 
 
 
520 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  26.69 
 
 
539 aa  120  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  27.84 
 
 
516 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.82 
 
 
507 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  28.37 
 
 
518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.45 
 
 
553 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  26.65 
 
 
526 aa  107  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  25.11 
 
 
526 aa  107  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  28.57 
 
 
570 aa  102  9e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.108543 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  26.98 
 
 
544 aa  97.8  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.81 
 
 
499 aa  96.3  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  25.35 
 
 
521 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  23.31 
 
 
528 aa  94.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  25.82 
 
 
538 aa  93.6  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  27.86 
 
 
514 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.123062 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.14 
 
 
517 aa  84.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  25.99 
 
 
502 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 
520 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 
543 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  25 
 
 
521 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 
521 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 
521 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  22.19 
 
 
515 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 
506 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  23.94 
 
 
523 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  25 
 
 
503 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 
538 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  22.35 
 
 
510 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 
522 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  23.97 
 
 
764 aa  67.8  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  22.17 
 
 
510 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  24.78 
 
 
513 aa  68.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 
527 aa  67  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08198  choline transporter, putative (Eurofung)  28.25 
 
 
509 aa  65.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.273035  normal  0.278378 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 
547 aa  65.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  21.73 
 
 
530 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  24.04 
 
 
547 aa  63.9  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  25 
 
 
539 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  25 
 
 
499 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 
494 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  25 
 
 
499 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  23.37 
 
 
516 aa  60.1  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  24.56 
 
 
531 aa  60.1  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  23.05 
 
 
505 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  23.65 
 
 
506 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 
492 aa  57  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 
496 aa  57  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  25 
 
 
496 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  25.44 
 
 
443 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 
443 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 
443 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  22.89 
 
 
486 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  22.89 
 
 
486 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  22.89 
 
 
486 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 
443 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  22.74 
 
 
527 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 
443 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 
443 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 
443 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 
443 aa  49.7  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 
443 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 
549 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0960  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 
446 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  22.86 
 
 
453 aa  47.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  24.13 
 
 
461 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 
449 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  23.42 
 
 
497 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  25.14 
 
 
452 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 
452 aa  43.9  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  25.14 
 
 
452 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  25.14 
 
 
452 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 
452 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  25.14 
 
 
452 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  25.14 
 
 
452 aa  43.9  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  25.14 
 
 
452 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  25.14 
 
 
452 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01702  conserved hypothetical protein  28.14 
 
 
391 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0232307  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  25.71 
 
 
452 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  25.71 
 
 
452 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  25.71 
 
 
452 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  25.71 
 
 
452 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>