More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3688 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 538 aa  1067    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  89.02 
 
 		 562 aa  813    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  59.92 
 
 		 521 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  59.32 
 
 		 506 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  59.92 
 
 		 521 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  59.92 
 
 		 521 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  47.38 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  46.77 
 
 		 503 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  44 
 
 		 519 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  40.71 
 
 		 531 aa  353  5e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  42.75 
 
 		 549 aa  323  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  29.96 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  29.66 
 
 		 494 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  29.7 
 
 		 505 aa  203  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  30.08 
 
 		 547 aa  187  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  30.44 
 
 		 527 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 486 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 486 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 486 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  27.47 
 
 		 505 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 502 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  29.61 
 
 		 496 aa  160  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  29.01 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  30.44 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  27.83 
 
 		 496 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  31.16 
 
 		 527 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 		 528 aa  153  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  30.22 
 
 		 539 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  30.22 
 
 		 499 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  28.94 
 
 		 492 aa  150  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 487 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  27.05 
 
 		 519 aa  147  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 		 497 aa  146  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  28.44 
 
 		 521 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  31.24 
 
 		 522 aa  143  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  28.73 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  27.89 
 
 		 504 aa  137  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  28.39 
 
 		 483 aa  134  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 510 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  27.56 
 
 		 510 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  29.87 
 
 		 516 aa  126  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  27.52 
 
 		 523 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  27.97 
 
 		 514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 543 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 520 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  30.52 
 
 		 522 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  30.73 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 514 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  28.34 
 
 		 443 aa  105  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  28.53 
 
 		 443 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 		 443 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  28.53 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 		 443 aa  103  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  28.07 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 443 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  28.8 
 
 		 456 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 456 aa  98.2  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 454 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 476 aa  97.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 492 aa  97.1  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  27.2 
 
 		 443 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 459 aa  95.9  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 476 aa  95.1  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  24.46 
 
 		 530 aa  94.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  24.84 
 
 		 526 aa  95.1  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  30.14 
 
 		 465 aa  95.1  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  27.83 
 
 		 456 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  24.49 
 
 		 518 aa  94.7  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 455 aa  94.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  26.1 
 
 		 434 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  28.16 
 
 		 455 aa  93.6  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  30.33 
 
 		 466 aa  93.2  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 454 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  26.96 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  27 
 
 		 539 aa  92.4  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 469 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  26.4 
 
 		 576 aa  91.7  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  29.08 
 
 		 471 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 481 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 		 468 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 		 468 aa  90.9  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 		 468 aa  90.9  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 		 462 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.15 
 
 		 532 aa  90.1  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 		 462 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  29.27 
 
 		 466 aa  90.5  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 		 462 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 465 aa  90.1  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 461 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  29 
 
 		 466 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  26.83 
 
 		 461 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  23.75 
 
 		 537 aa  89  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>