More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3379 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 505 aa  1000    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  60.12 
 
 		 483 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  60.12 
 
 		 483 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  60.95 
 
 		 487 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  60.29 
 
 		 483 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  58.2 
 
 		 483 aa  481  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  51.67 
 
 		 486 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  51.67 
 
 		 486 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  51.67 
 
 		 486 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  40.62 
 
 		 497 aa  337  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  35.4 
 
 		 505 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  33.48 
 
 		 494 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  33.63 
 
 		 506 aa  251  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  30.53 
 
 		 504 aa  219  6e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  31.56 
 
 		 547 aa  206  6e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  33.69 
 
 		 496 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  28.36 
 
 		 521 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 521 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 521 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  29.65 
 
 		 503 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  29.55 
 
 		 513 aa  176  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  28.2 
 
 		 506 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  27.31 
 
 		 538 aa  171  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  28.72 
 
 		 562 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  28.13 
 
 		 549 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  29.84 
 
 		 519 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  28.94 
 
 		 531 aa  143  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 502 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  26.61 
 
 		 521 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 510 aa  113  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  26.65 
 
 		 527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 496 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  23.03 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 539 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 499 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 499 aa  104  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 514 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  23.09 
 
 		 510 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 527 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  23.72 
 
 		 530 aa  97.8  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  23.76 
 
 		 510 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 514 aa  96.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  27.91 
 
 		 440 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  28.42 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  24.57 
 
 		 516 aa  94.4  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 522 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  25.82 
 
 		 427 aa  93.6  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  22.66 
 
 		 537 aa  92.8  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  24.95 
 
 		 571 aa  91.3  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  24.56 
 
 		 539 aa  89.7  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 503 aa  88.6  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  24.39 
 
 		 486 aa  88.2  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.48 
 
 		 499 aa  87.8  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  25.11 
 
 		 514 aa  87.8  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  22.54 
 
 		 527 aa  87  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 522 aa  86.7  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 		 454 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  22.09 
 
 		 530 aa  84.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  26.67 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.01 
 
 		 532 aa  84.3  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  23.87 
 
 		 523 aa  84.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  27.53 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  26.78 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  25.17 
 
 		 547 aa  81.3  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  27.74 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  25.87 
 
 		 570 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 		 543 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  25.13 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  22.92 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  23.53 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  21.63 
 
 		 526 aa  77.4  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  20.51 
 
 		 532 aa  77  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  23.16 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  22.27 
 
 		 519 aa  77  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13282  cationic amino acid transport integral membrane protein  24.32 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.260226 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  23.33 
 
 		 526 aa  76.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  24.25 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 		 515 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  24.15 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  21.93 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  23.4 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>