More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5201 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  99.02 
 
 		 510 aa  1016    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  94.7 
 
 		 510 aa  969    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 530 aa  1070    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  51.65 
 
 		 516 aa  477  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  49.7 
 
 		 522 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  47.62 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  47.54 
 
 		 520 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  46.65 
 
 		 543 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  47.1 
 
 		 523 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  33.65 
 
 		 519 aa  253  7e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  32.75 
 
 		 528 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  33.21 
 
 		 521 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  32.33 
 
 		 514 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  32.63 
 
 		 522 aa  206  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 		 527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  33.95 
 
 		 514 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  27.22 
 
 		 526 aa  155  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.94 
 
 		 542 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  27.17 
 
 		 530 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 		 494 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  26 
 
 		 547 aa  139  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  26.82 
 
 		 764 aa  138  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  25.47 
 
 		 537 aa  136  8e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.77 
 
 		 532 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  26.03 
 
 		 570 aa  130  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  26.43 
 
 		 518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  26.3 
 
 		 544 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 505 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 510 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 506 aa  120  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  25.09 
 
 		 570 aa  120  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 538 aa  119  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 521 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 521 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  24.52 
 
 		 538 aa  119  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  25.84 
 
 		 571 aa  118  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  27.24 
 
 		 503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  27.27 
 
 		 576 aa  114  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 549 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  29.18 
 
 		 520 aa  110  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 		 502 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 531 aa  107  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  23.61 
 
 		 502 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.71 
 
 		 553 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  26.38 
 
 		 513 aa  105  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 486 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 486 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 486 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  22.57 
 
 		 506 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 496 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.81 
 
 		 532 aa  99.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 		 499 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 		 539 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 		 499 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  25.95 
 
 		 514 aa  96.7  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  24.48 
 
 		 547 aa  96.7  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 497 aa  94  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 483 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 483 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  25.49 
 
 		 527 aa  90.9  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 505 aa  90.5  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 487 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  21.76 
 
 		 495 aa  87.8  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  22.57 
 
 		 547 aa  87  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  24.48 
 
 		 539 aa  85.1  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  24.01 
 
 		 516 aa  82  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  28.18 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.24 
 
 		 507 aa  80.5  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  22.33 
 
 		 516 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 		 504 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  25.87 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.25 
 
 		 527 aa  77  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  25.91 
 
 		 496 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  23.84 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  23.17 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  26.22 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.7 
 
 		 517 aa  73.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  24.57 
 
 		 462 aa  73.6  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  22.22 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  24.28 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.72 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  25.15 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  23.29 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 770 aa  70.1  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  26.08 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  22.83 
 
 		 517 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  24.4 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  23.01 
 
 		 455 aa  67  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  25.65 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  25.4 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  24.48 
 
 		 434 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  24.28 
 
 		 559 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>