More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3725 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 549 aa  1075    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  66.67 
 
 		 531 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  52.2 
 
 		 513 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  53.04 
 
 		 503 aa  448  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  52.35 
 
 		 519 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  43.28 
 
 		 521 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  42.94 
 
 		 521 aa  389  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  42.94 
 
 		 521 aa  389  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  42.27 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  42.35 
 
 		 538 aa  355  8.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  41.34 
 
 		 562 aa  327  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 		 494 aa  210  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  28.41 
 
 		 505 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 		 547 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  28.16 
 
 		 506 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 		 510 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  30.33 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  30.51 
 
 		 502 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  30.22 
 
 		 528 aa  161  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  31.65 
 
 		 483 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  31.13 
 
 		 527 aa  161  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  29.83 
 
 		 527 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  31.65 
 
 		 483 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  31.13 
 
 		 522 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  26.74 
 
 		 521 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  31.65 
 
 		 487 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  29.37 
 
 		 496 aa  153  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  31.53 
 
 		 519 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 497 aa  144  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  28.99 
 
 		 510 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 514 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  31.67 
 
 		 499 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 		 483 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 504 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  29.13 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  32.62 
 
 		 499 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  31.91 
 
 		 539 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  29.3 
 
 		 523 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  28.22 
 
 		 530 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  31 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  32.74 
 
 		 516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  29.18 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 543 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.18 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  25.47 
 
 		 518 aa  103  9e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.05 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  24.9 
 
 		 530 aa  101  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  25.82 
 
 		 570 aa  97.8  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.59 
 
 		 507 aa  94  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 		 447 aa  90.5  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  28.46 
 
 		 455 aa  90.1  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  24.39 
 
 		 526 aa  89.4  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 463 aa  87  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 		 463 aa  87  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  22.65 
 
 		 463 aa  87  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  29.17 
 
 		 468 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  23.22 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  23.22 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  23.66 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.4 
 
 		 542 aa  84  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  30.14 
 
 		 539 aa  84  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  25.76 
 
 		 502 aa  83.6  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 462 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  24.69 
 
 		 462 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 454 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 462 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  22.56 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  22.56 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  22.69 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  23.77 
 
 		 538 aa  82  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  20.92 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  27.45 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  23.27 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  24.32 
 
 		 544 aa  80.5  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  22.04 
 
 		 571 aa  80.5  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  29.08 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  24.58 
 
 		 514 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.14 
 
 		 532 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  24.77 
 
 		 570 aa  80.1  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  27.39 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  22.8 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  26.52 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  23.99 
 
 		 576 aa  77.8  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  26.88 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.96 
 
 		 517 aa  76.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  21.39 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  21.39 
 
 		 461 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  21.39 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>