More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1734 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 506 aa  1003    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  71.37 
 
 		 505 aa  707    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  56.22 
 
 		 494 aa  554  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  36.93 
 
 		 547 aa  295  1e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  35.34 
 
 		 486 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  35.34 
 
 		 486 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  35.34 
 
 		 486 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  34.07 
 
 		 505 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  33.33 
 
 		 496 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  34.98 
 
 		 483 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  34.98 
 
 		 483 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  35.21 
 
 		 487 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  33.56 
 
 		 483 aa  229  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  32.89 
 
 		 497 aa  227  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  30.81 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 		 504 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  34.24 
 
 		 483 aa  216  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  31.63 
 
 		 521 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  31.63 
 
 		 521 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  31.8 
 
 		 521 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  29.8 
 
 		 538 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  29.4 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  28.6 
 
 		 513 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  30.58 
 
 		 502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  30.1 
 
 		 562 aa  176  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  29.67 
 
 		 519 aa  167  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 549 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 		 531 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 514 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 528 aa  138  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 527 aa  137  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  24.3 
 
 		 521 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  24.89 
 
 		 519 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 522 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  27.5 
 
 		 539 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 499 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 510 aa  123  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.79 
 
 		 542 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 496 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  26.06 
 
 		 527 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  25.35 
 
 		 570 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  24.12 
 
 		 510 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  23.01 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 		 514 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  22.87 
 
 		 530 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 522 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  25.59 
 
 		 538 aa  104  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  24.06 
 
 		 530 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  22.89 
 
 		 532 aa  101  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  23.15 
 
 		 516 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.9 
 
 		 527 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.28 
 
 		 507 aa  97.4  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  22.53 
 
 		 571 aa  96.7  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  23.32 
 
 		 518 aa  95.9  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  25.08 
 
 		 461 aa  92.8  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  22.56 
 
 		 515 aa  91.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 455 aa  91.3  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  23.6 
 
 		 526 aa  91.3  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  21.7 
 
 		 547 aa  88.6  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  22.95 
 
 		 537 aa  88.2  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  26.1 
 
 		 434 aa  87  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  26.55 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  22.46 
 
 		 517 aa  84.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  23.28 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  24.95 
 
 		 518 aa  84  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  23.53 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  23.58 
 
 		 539 aa  84.3  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2591  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 		 454 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196035 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  23.93 
 
 		 764 aa  83.6  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  19.92 
 
 		 532 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 449 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  23.18 
 
 		 576 aa  81.6  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  21.52 
 
 		 514 aa  81.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  25.06 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  23.56 
 
 		 456 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  22.75 
 
 		 516 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  24.47 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  24.16 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  24.23 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  24.68 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  22.76 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  22.76 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  24.24 
 
 		 523 aa  77.4  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 725 aa  77.4  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.03 
 
 		 499 aa  76.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  22.49 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  23.26 
 
 		 459 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  22.39 
 
 		 520 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  22.59 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  25.37 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  24.11 
 
 		 570 aa  75.5  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>