More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3928 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  88.89 
 
 		 539 aa  812    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  89.09 
 
 		 499 aa  815    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 492 aa  979    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  94.03 
 
 		 496 aa  871    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  88.89 
 
 		 499 aa  812    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  72.93 
 
 		 527 aa  680    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  29.16 
 
 		 506 aa  202  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  29.47 
 
 		 521 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  29.47 
 
 		 521 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  30.04 
 
 		 510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  32.67 
 
 		 503 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  33.03 
 
 		 502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  29.31 
 
 		 521 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  33.19 
 
 		 513 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 		 547 aa  173  6.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 		 538 aa  171  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  30.95 
 
 		 527 aa  166  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  28.41 
 
 		 514 aa  160  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  30.2 
 
 		 519 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  31.04 
 
 		 531 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  33.41 
 
 		 519 aa  153  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  28.89 
 
 		 518 aa  151  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 494 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 505 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 562 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  27.11 
 
 		 510 aa  134  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  25.55 
 
 		 538 aa  133  6.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  27.25 
 
 		 530 aa  133  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 510 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 522 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 506 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 530 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.01 
 
 		 542 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  28.1 
 
 		 514 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 		 520 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 		 505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 		 543 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 516 aa  118  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  25.41 
 
 		 547 aa  118  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 		 497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  25.93 
 
 		 570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.78 
 
 		 532 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  26.3 
 
 		 544 aa  113  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  27.07 
 
 		 496 aa  113  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  24.66 
 
 		 571 aa  112  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 487 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  27.46 
 
 		 523 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  25 
 
 		 570 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  27.15 
 
 		 514 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  23.77 
 
 		 526 aa  108  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 483 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.4 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  23.75 
 
 		 539 aa  97.8  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.47 
 
 		 532 aa  95.9  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  21.59 
 
 		 547 aa  95.5  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 504 aa  92.8  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 482 aa  90.5  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 482 aa  90.5  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  21.74 
 
 		 495 aa  90.1  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  21.98 
 
 		 537 aa  89.7  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.53 
 
 		 507 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  24.52 
 
 		 502 aa  86.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  28.41 
 
 		 725 aa  85.9  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  25.96 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  26.61 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  22.37 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  26.89 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  23.34 
 
 		 520 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  45.36 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  25 
 
 		 553 aa  80.5  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  26.27 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  23.39 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  23.39 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  23.39 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  35.71 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  23.39 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  23.39 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  26.33 
 
 		 753 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  23.39 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  25.19 
 
 		 496 aa  77  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  23.2 
 
 		 576 aa  76.6  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  23.15 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  23.61 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>