More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1845 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 522 aa  1039    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  62.83 
 
 		 516 aa  569  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  48.83 
 
 		 530 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  48.63 
 
 		 510 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  48.54 
 
 		 510 aa  458  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  47.22 
 
 		 515 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  48.37 
 
 		 543 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  48.37 
 
 		 520 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  46.46 
 
 		 523 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  33.64 
 
 		 519 aa  230  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  33.95 
 
 		 528 aa  224  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  32.34 
 
 		 521 aa  213  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  32.09 
 
 		 514 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  35.05 
 
 		 527 aa  183  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  30.13 
 
 		 522 aa  169  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  32.68 
 
 		 514 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  29.8 
 
 		 547 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 494 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  25.96 
 
 		 526 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  27.63 
 
 		 518 aa  125  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  23.93 
 
 		 571 aa  125  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  26 
 
 		 537 aa  122  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  24.31 
 
 		 570 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  26.89 
 
 		 530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  26.07 
 
 		 544 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.46 
 
 		 532 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.62 
 
 		 542 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  29.37 
 
 		 549 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  27.24 
 
 		 521 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  27.24 
 
 		 521 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  25.21 
 
 		 538 aa  107  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 531 aa  107  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 521 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  30.37 
 
 		 538 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  27.17 
 
 		 764 aa  105  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  25.14 
 
 		 520 aa  103  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  27.1 
 
 		 503 aa  103  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 510 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  23.49 
 
 		 570 aa  100  6e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 506 aa  100  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  25.65 
 
 		 547 aa  99.4  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  25.46 
 
 		 514 aa  97.4  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  25.25 
 
 		 576 aa  93.6  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.56 
 
 		 553 aa  93.6  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 499 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 499 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 539 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 		 496 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  22.8 
 
 		 495 aa  84.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  23.77 
 
 		 539 aa  83.6  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.77 
 
 		 532 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  26.56 
 
 		 527 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 562 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  24.22 
 
 		 516 aa  80.1  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  22.54 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  23.96 
 
 		 502 aa  77.8  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  26.53 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.18 
 
 		 499 aa  73.6  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.88 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475155 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 515 aa  68.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  25.48 
 
 		 542 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.27 
 
 		 507 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  23.26 
 
 		 526 aa  66.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  23.96 
 
 		 516 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  25.48 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  37.01 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  37.01 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3137  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 663 aa  63.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0382789  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.66 
 
 		 527 aa  63.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 477 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  24.69 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  31.94 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  37.01 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  37.01 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  37.01 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  33.33 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  33.33 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  36.22 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  31.93 
 
 		 513 aa  60.1  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  24.58 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.19 
 
 		 517 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>