More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_07392 on replicon BN001304
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  100 
 
 
495 aa  1007    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  35.87 
 
 
571 aa  335  9e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  34.51 
 
 
539 aa  304  3.0000000000000004e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  35.07 
 
 
518 aa  303  6.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  33.84 
 
 
542 aa  302  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  32.21 
 
 
518 aa  265  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  32.34 
 
 
576 aa  256  8e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  32.18 
 
 
530 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  32.99 
 
 
520 aa  242  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  29.09 
 
 
516 aa  236  8e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  30.36 
 
 
514 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.538203 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  29.47 
 
 
532 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  30.02 
 
 
542 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  28.46 
 
 
526 aa  224  4e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  29.13 
 
 
532 aa  212  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  29.47 
 
 
527 aa  209  6e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  30.37 
 
 
516 aa  207  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  28.57 
 
 
519 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  29.45 
 
 
528 aa  195  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  26.55 
 
 
526 aa  187  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  28.27 
 
 
547 aa  178  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  29.8 
 
 
537 aa  176  6e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 
514 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.22 
 
 
499 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.9 
 
 
507 aa  167  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  25.65 
 
 
570 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.292579 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.22 
 
 
442 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475155 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  30.87 
 
 
517 aa  153  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  25.91 
 
 
502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 
514 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  25.05 
 
 
570 aa  143  8e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  26.64 
 
 
521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  27.27 
 
 
547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  28.13 
 
 
527 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  27.25 
 
 
544 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.34 
 
 
553 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  25.53 
 
 
764 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 
522 aa  117  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308026 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08198  choline transporter, putative (Eurofung)  32.16 
 
 
509 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.273035  normal  0.278378 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  22.62 
 
 
538 aa  106  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  25.1 
 
 
494 aa  99  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  22.92 
 
 
510 aa  97.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  21.98 
 
 
530 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  21.65 
 
 
510 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  22.68 
 
 
522 aa  90.1  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 
516 aa  87  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 
486 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  22.6 
 
 
506 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 
486 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  25.53 
 
 
513 aa  83.2  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 
486 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  23.4 
 
 
496 aa  82.4  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  19.96 
 
 
527 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 
492 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  25 
 
 
497 aa  80.9  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  20.85 
 
 
515 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  22.44 
 
 
521 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 
483 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 
483 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  23.19 
 
 
523 aa  77  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 
539 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 
499 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 
521 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 
521 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 
499 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  23.26 
 
 
496 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 
538 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  23.09 
 
 
505 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 
487 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 
505 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  23.31 
 
 
455 aa  70.5  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 
483 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  21.6 
 
 
543 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  21.87 
 
 
520 aa  68.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  22.2 
 
 
502 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 
492 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 
468 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  20 
 
 
503 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01702  conserved hypothetical protein  25.89 
 
 
391 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0232307  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 
483 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 
547 aa  62.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  21.77 
 
 
506 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 
562 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 
454 aa  60.1  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  26.7 
 
 
496 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  26.52 
 
 
519 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 
441 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 
447 aa  58.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 
443 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 
443 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  28.76 
 
 
500 aa  57  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 
549 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  23.24 
 
 
531 aa  57  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  25.82 
 
 
443 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 
440 aa  55.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 
450 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  24.65 
 
 
450 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_006686  CND00510  amino acid transporter, putative  23.75 
 
 
556 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.100955  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 
443 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 
510 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>