286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39042 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  100 
 
 		 570 aa  1152    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  48.87 
 
 		 547 aa  485  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  43.52 
 
 		 544 aa  431  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  40.82 
 
 		 553 aa  356  6.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  33.07 
 
 		 570 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  29.64 
 
 		 526 aa  216  7e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  29.45 
 
 		 538 aa  198  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 		 528 aa  194  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  27.04 
 
 		 514 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.45 
 
 		 532 aa  187  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  27.72 
 
 		 519 aa  184  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.46 
 
 		 542 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  28.08 
 
 		 571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  28.54 
 
 		 521 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  27.01 
 
 		 530 aa  170  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  25.98 
 
 		 518 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  26.74 
 
 		 539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  28.74 
 
 		 502 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 		 514 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  27.46 
 
 		 576 aa  156  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.69 
 
 		 527 aa  154  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  28.86 
 
 		 522 aa  152  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  28.84 
 
 		 527 aa  150  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  25.35 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  25.05 
 
 		 495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  26.49 
 
 		 547 aa  139  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.8 
 
 		 532 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.48 
 
 		 507 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  24.9 
 
 		 542 aa  134  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  23.59 
 
 		 516 aa  133  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  26.73 
 
 		 520 aa  131  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  25.29 
 
 		 526 aa  122  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  23.58 
 
 		 518 aa  121  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  25.09 
 
 		 530 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  24.07 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  24.31 
 
 		 537 aa  109  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  26.67 
 
 		 523 aa  107  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 516 aa  107  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  22.55 
 
 		 543 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.35 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  24.95 
 
 		 515 aa  104  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  24.75 
 
 		 496 aa  103  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.57 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 520 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 522 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  21.95 
 
 		 516 aa  90.9  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  23.55 
 
 		 539 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 492 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 		 499 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  25 
 
 		 527 aa  87.8  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 		 499 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.42 
 
 		 517 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 		 496 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 		 503 aa  80.5  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  22.5 
 
 		 764 aa  79  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  22.64 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 538 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  25.82 
 
 		 543 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  23.36 
 
 		 547 aa  73.9  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  24.91 
 
 		 505 aa  72  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 506 aa  72  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  23.1 
 
 		 502 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  23.93 
 
 		 497 aa  68.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  23.02 
 
 		 521 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 521 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 521 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  23.37 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  22.96 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 576 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  23.54 
 
 		 531 aa  65.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 544 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  23.83 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  22.51 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 716 aa  63.5  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  25.28 
 
 		 559 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 		 555 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 		 740 aa  60.5  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08198  choline transporter, putative (Eurofung)  29.79 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.273035  normal  0.278378 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  23.47 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  23.21 
 
 		 471 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  23.7 
 
 		 467 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  23.5 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  22.96 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 786 aa  58.9  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  22.96 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  22.96 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  22.96 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  24.7 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  22.96 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  22.96 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  23.1 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  23.35 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>