224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0796 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  100 
 
 		 521 aa  1050    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  60.5 
 
 		 527 aa  624  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  53.05 
 
 		 522 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  46.55 
 
 		 528 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  45.44 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  37.18 
 
 		 514 aa  310  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  39.88 
 
 		 514 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  33.15 
 
 		 510 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  33.21 
 
 		 530 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  33.7 
 
 		 510 aa  238  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  33.79 
 
 		 515 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  35.12 
 
 		 523 aa  226  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  34.31 
 
 		 543 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  35.93 
 
 		 520 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  32.34 
 
 		 522 aa  213  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  29.47 
 
 		 526 aa  203  5e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  29.01 
 
 		 570 aa  203  6e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  33.52 
 
 		 516 aa  196  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  29.3 
 
 		 518 aa  192  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  31.65 
 
 		 544 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  28.71 
 
 		 530 aa  184  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.38 
 
 		 542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  28.54 
 
 		 570 aa  173  5e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  30.18 
 
 		 496 aa  169  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  28.14 
 
 		 576 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  26.42 
 
 		 538 aa  165  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.64 
 
 		 532 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  29.48 
 
 		 499 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  29.48 
 
 		 499 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  29.48 
 
 		 539 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 547 aa  158  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  29.47 
 
 		 527 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  29.31 
 
 		 492 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 505 aa  154  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  29.63 
 
 		 494 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  25.29 
 
 		 547 aa  144  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  29.92 
 
 		 553 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 521 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 521 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  27.63 
 
 		 502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  26.9 
 
 		 520 aa  140  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 		 506 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  28.44 
 
 		 538 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  28.14 
 
 		 513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  23.75 
 
 		 537 aa  133  9e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  26.64 
 
 		 495 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  26.38 
 
 		 547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  24.3 
 
 		 506 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  24.47 
 
 		 571 aa  130  8.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 531 aa  126  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 502 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.37 
 
 		 527 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  23.58 
 
 		 514 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.1 
 
 		 532 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 505 aa  107  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 562 aa  107  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  26.03 
 
 		 764 aa  104  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  25.71 
 
 		 519 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  24.72 
 
 		 542 aa  97.8  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  26.2 
 
 		 496 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 510 aa  97.1  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.35 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475155 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  24.39 
 
 		 516 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 483 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 483 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 		 487 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 497 aa  90.5  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 483 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 504 aa  90.1  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  22.3 
 
 		 507 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.01 
 
 		 499 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.95 
 
 		 517 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  22.29 
 
 		 539 aa  86.7  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  23.08 
 
 		 526 aa  85.9  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  28.24 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  22.88 
 
 		 518 aa  84.7  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  22.94 
 
 		 516 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  27.03 
 
 		 452 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  27.03 
 
 		 452 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  27.03 
 
 		 452 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  27.03 
 
 		 452 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  27.03 
 
 		 452 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  27.03 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  27.03 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  27.03 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  27.03 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  27.03 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  27.03 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  27.03 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  27.13 
 
 		 427 aa  66.6  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>