263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2277 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 522 aa  1042    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  66.09 
 
 		 527 aa  673    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  53.05 
 
 		 521 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  39.24 
 
 		 528 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  39.5 
 
 		 519 aa  323  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  42.86 
 
 		 514 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  34.63 
 
 		 514 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  33.53 
 
 		 510 aa  216  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  32.95 
 
 		 530 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  33.01 
 
 		 510 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  34.18 
 
 		 523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  34.12 
 
 		 543 aa  194  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  32.9 
 
 		 516 aa  186  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  31.85 
 
 		 515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  30.57 
 
 		 522 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  26.49 
 
 		 570 aa  166  8e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 505 aa  160  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  28.86 
 
 		 570 aa  153  7e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  26.74 
 
 		 526 aa  153  8e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  30.31 
 
 		 513 aa  153  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  25.88 
 
 		 530 aa  147  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  28.46 
 
 		 547 aa  145  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  31.24 
 
 		 538 aa  143  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 503 aa  143  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  26.19 
 
 		 518 aa  141  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  27.98 
 
 		 544 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 494 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  28.1 
 
 		 521 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  26.28 
 
 		 576 aa  137  4e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 506 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 521 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 521 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.7 
 
 		 542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 		 506 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  27.13 
 
 		 547 aa  128  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 		 531 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  31.19 
 
 		 549 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  24.86 
 
 		 537 aa  123  7e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  24.52 
 
 		 538 aa  122  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.37 
 
 		 532 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.48 
 
 		 532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 562 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  25.24 
 
 		 547 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 		 496 aa  114  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  28.08 
 
 		 520 aa  113  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.24 
 
 		 527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  27.72 
 
 		 502 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  24.41 
 
 		 495 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  28.15 
 
 		 486 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  28.15 
 
 		 486 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  28.15 
 
 		 486 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 492 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  25.68 
 
 		 527 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  27.29 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  27.25 
 
 		 496 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.59 
 
 		 553 aa  103  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  23.75 
 
 		 571 aa  103  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  29.28 
 
 		 519 aa  103  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  25.92 
 
 		 518 aa  101  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  23.78 
 
 		 539 aa  99.4  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 539 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 499 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 499 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 		 483 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 		 483 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 		 487 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  25.33 
 
 		 764 aa  95.1  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 483 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 505 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 497 aa  91.3  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 483 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  24.64 
 
 		 542 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  24.17 
 
 		 514 aa  87.4  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  21.95 
 
 		 507 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 504 aa  83.6  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.72 
 
 		 517 aa  81.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  26.94 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  26.94 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.83 
 
 		 442 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475155 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  22.39 
 
 		 516 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  25.26 
 
 		 526 aa  68.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  27.09 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 		 459 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  27.65 
 
 		 461 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  26.82 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  26.82 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  27.37 
 
 		 461 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  26.82 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  26.82 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 		 454 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2421  amino acid permease family protein  25.25 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>