More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4043 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 510 aa  1019    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  30.87 
 
 		 502 aa  195  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  30.85 
 
 		 496 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  29.81 
 
 		 521 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  29.76 
 
 		 521 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  29.76 
 
 		 521 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  29.45 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  30.97 
 
 		 513 aa  169  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  30.37 
 
 		 499 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  30.25 
 
 		 539 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 		 499 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  28.29 
 
 		 503 aa  161  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 		 494 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  29.01 
 
 		 538 aa  151  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 		 531 aa  149  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  30.3 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 		 505 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  27.66 
 
 		 527 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 		 549 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  27.71 
 
 		 562 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  30.05 
 
 		 515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  30 
 
 		 523 aa  126  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 		 543 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  26.98 
 
 		 510 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  30.91 
 
 		 520 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  28.84 
 
 		 528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 510 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 530 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 		 506 aa  120  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 483 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 483 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  24.81 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 505 aa  104  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 514 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 		 522 aa  101  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 		 483 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  29.06 
 
 		 486 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  29.06 
 
 		 486 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  29.06 
 
 		 486 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 522 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  25.21 
 
 		 521 aa  97.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 		 483 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  23.58 
 
 		 514 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 455 aa  91.3  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 527 aa  87.8  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 497 aa  86.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  26.29 
 
 		 496 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  27.15 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  23.41 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  27.56 
 
 		 516 aa  83.6  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 		 454 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  23.86 
 
 		 526 aa  83.2  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  27.1 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  26.59 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  23.7 
 
 		 538 aa  80.5  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  28.03 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  23.59 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  24.92 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  24.92 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  24.92 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  24.92 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  24.92 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  28.32 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.37 
 
 		 532 aa  77  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  25.33 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  25.33 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  24.58 
 
 		 576 aa  76.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  30.97 
 
 		 446 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  25 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  22.4 
 
 		 570 aa  75.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  25.72 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  24.15 
 
 		 514 aa  75.1  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  26.04 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  24.67 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  25.35 
 
 		 544 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  24.8 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  27.94 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  23.25 
 
 		 475 aa  70.1  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  24.25 
 
 		 539 aa  69.3  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 466 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  23.3 
 
 		 489 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  26.59 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  25.28 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>