151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC06480 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  100 
 
 		 526 aa  1075    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  38.31 
 
 		 502 aa  334  3e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  32.45 
 
 		 570 aa  261  3e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 519 aa  250  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  32.41 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  29.08 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  31.81 
 
 		 544 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  31.83 
 
 		 547 aa  223  4.9999999999999996e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  30.93 
 
 		 528 aa  223  9e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  28.22 
 
 		 518 aa  219  8.999999999999998e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  29.64 
 
 		 570 aa  216  7e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  32.29 
 
 		 576 aa  213  5.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  31.18 
 
 		 553 aa  208  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  31.86 
 
 		 514 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  28.96 
 
 		 530 aa  204  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  29.47 
 
 		 521 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  29.39 
 
 		 520 aa  200  6e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  26.39 
 
 		 571 aa  196  7e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.57 
 
 		 532 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  26.55 
 
 		 495 aa  184  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.06 
 
 		 542 aa  184  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  27.52 
 
 		 539 aa  183  7e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  24.2 
 
 		 526 aa  177  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  25.68 
 
 		 514 aa  176  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.63 
 
 		 527 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  28.93 
 
 		 542 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 		 527 aa  166  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  26.25 
 
 		 537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  26.88 
 
 		 547 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.21 
 
 		 507 aa  161  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 510 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.2 
 
 		 532 aa  151  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  27.13 
 
 		 510 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 		 522 aa  147  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  25.05 
 
 		 516 aa  138  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  28.82 
 
 		 516 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.88 
 
 		 517 aa  133  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  25.34 
 
 		 516 aa  131  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  26.31 
 
 		 523 aa  126  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  26.57 
 
 		 518 aa  124  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 506 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  24.56 
 
 		 543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  24.62 
 
 		 764 aa  114  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 521 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 521 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 521 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  23.14 
 
 		 515 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.11 
 
 		 442 aa  107  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475155 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.14 
 
 		 499 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  25.49 
 
 		 494 aa  100  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  24.12 
 
 		 496 aa  95.5  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 505 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  23.22 
 
 		 492 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 538 aa  86.7  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  23.47 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  23.43 
 
 		 539 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  22.9 
 
 		 496 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  23.47 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 		 506 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  24.69 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 510 aa  83.2  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  23.43 
 
 		 497 aa  81.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  25.14 
 
 		 513 aa  80.9  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 		 503 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  22.17 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  22.17 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  22.17 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 531 aa  71.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  23.59 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08198  choline transporter, putative (Eurofung)  23.79 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.273035  normal  0.278378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  23.91 
 
 		 527 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  22.02 
 
 		 502 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  24.04 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 549 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 		 483 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  23.72 
 
 		 496 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 		 483 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 471 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 453 aa  50.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.55 
 
 		 471 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01702  conserved hypothetical protein  24.69 
 
 		 391 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0232307  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 429 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  22.84 
 
 		 462 aa  48.5  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 		 463 aa  48.9  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  23.49 
 
 		 470 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3130  amino acid permease-associated region  23.49 
 
 		 460 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 		 485 aa  47.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.15 
 
 		 471 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  23.8 
 
 		 464 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 483 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 471 aa  47.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 459 aa  47  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  24.85 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  24.85 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  24.85 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  24.85 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>