226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF00330 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  100 
 
 		 496 aa  1006    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 528 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 514 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  27.42 
 
 		 518 aa  118  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  23.9 
 
 		 576 aa  113  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.05 
 
 		 532 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  28.88 
 
 		 544 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  24.75 
 
 		 570 aa  103  6e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  25 
 
 		 530 aa  103  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  24.68 
 
 		 519 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  25 
 
 		 570 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  30.12 
 
 		 527 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.71 
 
 		 553 aa  97.4  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  24.12 
 
 		 526 aa  95.5  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  24.05 
 
 		 518 aa  94.4  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  26.72 
 
 		 538 aa  91.7  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.21 
 
 		 507 aa  90.9  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  22.86 
 
 		 526 aa  88.6  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.16 
 
 		 517 aa  87.8  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 514 aa  87  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  28.24 
 
 		 521 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  25.62 
 
 		 542 aa  83.6  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  23.23 
 
 		 571 aa  83.6  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.56 
 
 		 542 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.64 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  28.01 
 
 		 764 aa  81.3  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  26.07 
 
 		 547 aa  81.3  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  23.4 
 
 		 495 aa  80.1  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 530 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.35 
 
 		 527 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  24.63 
 
 		 539 aa  74.7  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 515 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  25.23 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  23.15 
 
 		 516 aa  71.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  25.18 
 
 		 527 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  22.2 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 531 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 505 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  23.34 
 
 		 516 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 		 543 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  21 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  24.37 
 
 		 520 aa  67  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2021  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 		 480 aa  67  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 492 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 539 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  26.61 
 
 		 523 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 499 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  25.65 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  23.73 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  23.73 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  23.86 
 
 		 547 aa  62  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 520 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  25.27 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  21.38 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 		 497 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3753  amino acid permease-associated region  23.93 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0686  beta-alanine/gamma-aminobutyrate-H+ symporter  24.63 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4364  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  24.47 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 476 aa  57  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  25 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 450 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  23.34 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  23.73 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4672  amino acid permease family protein  28.47 
 
 		 465 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.1139e-21 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  30.9 
 
 		 452 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0665  amino acid permease family protein  28.47 
 
 		 465 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  23.1 
 
 		 475 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  30.9 
 
 		 452 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  30.9 
 
 		 452 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 516 aa  54.7  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  30.9 
 
 		 452 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  30.9 
 
 		 452 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  30.34 
 
 		 452 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  30.34 
 
 		 452 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  23.1 
 
 		 473 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  30.34 
 
 		 452 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>