More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5923 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 514 aa  1016    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  48.24 
 
 		 519 aa  462  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  43.97 
 
 		 514 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  48.07 
 
 		 528 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  40.42 
 
 		 521 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  40.78 
 
 		 527 aa  346  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  38.3 
 
 		 522 aa  307  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  32.28 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  34.55 
 
 		 510 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  30.78 
 
 		 518 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  34.32 
 
 		 510 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  34.1 
 
 		 530 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  30.72 
 
 		 530 aa  205  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  29.77 
 
 		 542 aa  204  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  35.61 
 
 		 516 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  31.46 
 
 		 522 aa  184  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  31.69 
 
 		 515 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  31.95 
 
 		 523 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  28.43 
 
 		 570 aa  180  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  27.89 
 
 		 570 aa  179  7e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  31.03 
 
 		 543 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  30.98 
 
 		 520 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 505 aa  167  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  26.3 
 
 		 502 aa  166  9e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  26.45 
 
 		 537 aa  166  9e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 		 547 aa  164  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  26.54 
 
 		 576 aa  163  8.000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  28.6 
 
 		 547 aa  161  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 503 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  24.32 
 
 		 538 aa  155  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  27.31 
 
 		 494 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 506 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  27.63 
 
 		 495 aa  150  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.36 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  27.18 
 
 		 544 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  25.41 
 
 		 571 aa  141  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 521 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 506 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  26.56 
 
 		 520 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  28.81 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  28.81 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  27.03 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.81 
 
 		 532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  26.33 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.62 
 
 		 553 aa  126  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 		 538 aa  123  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  25.92 
 
 		 764 aa  123  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  24.72 
 
 		 539 aa  118  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  25.67 
 
 		 527 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.1 
 
 		 527 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  28.97 
 
 		 496 aa  110  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 502 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.27 
 
 		 499 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.35 
 
 		 507 aa  107  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  27.39 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  25.52 
 
 		 547 aa  104  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 486 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 486 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 		 549 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 486 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.93 
 
 		 517 aa  100  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  25.76 
 
 		 516 aa  99.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 		 562 aa  97.4  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 505 aa  97.1  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.25 
 
 		 442 aa  92  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475155 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  24.12 
 
 		 542 aa  90.9  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 497 aa  90.9  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  24.04 
 
 		 526 aa  90.5  7e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  30.39 
 
 		 496 aa  90.1  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  27.76 
 
 		 519 aa  89  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  22.22 
 
 		 516 aa  88.2  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  24.36 
 
 		 483 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  24.36 
 
 		 483 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01702  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 391 aa  86.7  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0232307  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 487 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  23.23 
 
 		 518 aa  84.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  25.82 
 
 		 530 aa  73.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  22.62 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  25.18 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  20.88 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  20.36 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  21.45 
 
 		 473 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  24.69 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  20.88 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  20.88 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  23.64 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1143  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00088107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>