More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2300 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 486 aa  949    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 486 aa  949    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 486 aa  949    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  55.35 
 
 		 483 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  55.35 
 
 		 483 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  56.17 
 
 		 487 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  55.12 
 
 		 483 aa  455  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  55.35 
 
 		 483 aa  458  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  51.67 
 
 		 505 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  40.97 
 
 		 497 aa  340  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  35.7 
 
 		 494 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  36.76 
 
 		 505 aa  276  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  35.34 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  36.42 
 
 		 496 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  31.51 
 
 		 504 aa  229  9e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  32.32 
 
 		 547 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 		 503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  30.34 
 
 		 521 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  30.34 
 
 		 521 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  30.14 
 
 		 521 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  28.69 
 
 		 506 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 538 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  28.8 
 
 		 513 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  31.32 
 
 		 519 aa  150  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  28.75 
 
 		 549 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 531 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 		 514 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  27.48 
 
 		 528 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 527 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  27.5 
 
 		 492 aa  120  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  28.25 
 
 		 527 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  30.63 
 
 		 562 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  25.57 
 
 		 510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 499 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 499 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 539 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 530 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 510 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  29.06 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 543 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 502 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 		 520 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  27.81 
 
 		 523 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  25.55 
 
 		 518 aa  104  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 514 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 516 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  27 
 
 		 519 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  26.02 
 
 		 521 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 441 aa  100  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  26.33 
 
 		 547 aa  99.4  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.7 
 
 		 542 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  27.89 
 
 		 482 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  27.89 
 
 		 482 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  24.57 
 
 		 570 aa  98.2  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  22.98 
 
 		 537 aa  97.8  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 466 aa  97.1  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  22.56 
 
 		 526 aa  96.7  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 		 468 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  27.9 
 
 		 468 aa  96.3  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  25.28 
 
 		 571 aa  95.1  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 		 468 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 		 468 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  26.94 
 
 		 483 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 		 466 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 		 466 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  25.33 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  28.64 
 
 		 467 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  28.64 
 
 		 467 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  28.64 
 
 		 467 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  28.64 
 
 		 467 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  28.64 
 
 		 467 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  28.64 
 
 		 467 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  28.89 
 
 		 467 aa  90.9  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  28.64 
 
 		 467 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  25.78 
 
 		 440 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 440 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  22.58 
 
 		 530 aa  90.1  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  26.44 
 
 		 544 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 449 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  27.05 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  26.86 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  26.98 
 
 		 538 aa  88.6  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 462 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 462 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 462 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  25.35 
 
 		 539 aa  87.8  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 455 aa  87  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  27.39 
 
 		 471 aa  87  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  27.39 
 
 		 471 aa  87  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  27.39 
 
 		 471 aa  87  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 463 aa  86.7  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  25.34 
 
 		 570 aa  86.3  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  27.99 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  29.19 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>