More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3846 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 497 aa  967    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  40.97 
 
 		 486 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  40.97 
 
 		 486 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  40.62 
 
 		 505 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  40.97 
 
 		 486 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  42.83 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  43.55 
 
 		 483 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  43.55 
 
 		 483 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  43.97 
 
 		 487 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  43.19 
 
 		 483 aa  331  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  35.43 
 
 		 505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  33.69 
 
 		 494 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  32.96 
 
 		 506 aa  230  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  32.26 
 
 		 496 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 504 aa  201  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  30.08 
 
 		 547 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 		 503 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 538 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  28.72 
 
 		 531 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  28.12 
 
 		 513 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 		 562 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  26.95 
 
 		 549 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  27.26 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  28.15 
 
 		 527 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 502 aa  107  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 530 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 528 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 492 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 510 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 		 539 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 499 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  25.74 
 
 		 521 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 		 499 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  26.07 
 
 		 519 aa  100  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  28.22 
 
 		 510 aa  99.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.96 
 
 		 507 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 527 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  26.72 
 
 		 514 aa  94.4  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  27.08 
 
 		 523 aa  94.4  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 510 aa  93.2  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 514 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.32 
 
 		 542 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  23.43 
 
 		 526 aa  89  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  25.16 
 
 		 571 aa  89  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 441 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2591  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196035 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 516 aa  86.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  26.22 
 
 		 518 aa  85.9  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  27.56 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 514 aa  84.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  24.74 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  26.78 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 515 aa  83.2  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.55 
 
 		 527 aa  80.9  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  23.46 
 
 		 539 aa  79.7  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  23.04 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.59 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  24.55 
 
 		 530 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  24.94 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  25.69 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  22.56 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  26.53 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  27.5 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.2 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 543 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  25.96 
 
 		 465 aa  73.2  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 490 aa  72.8  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  26.29 
 
 		 547 aa  72  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  26.38 
 
 		 466 aa  72  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  25.11 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45240  putative amino acid permease  25.64 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  25.49 
 
 		 427 aa  72  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1487  amino acid transporter  25 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.838437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  22.94 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  27.32 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  23.93 
 
 		 570 aa  70.5  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  22.94 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 		 496 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>