More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2591 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3841  putative amino acid permease  80 
 
 		 455 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2591  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 454 aa  887    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45240  putative amino acid permease  80.88 
 
 		 455 aa  704    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1106  amino acid permease  57.49 
 
 		 469 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1685  amino acid transporter  57.98 
 
 		 468 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179988  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1020  amino acid permease  57.49 
 
 		 470 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1651  amino acid permease  57.49 
 
 		 468 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2325  amino acid permease  57.49 
 
 		 469 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3736  amino acid permease-associated region  57.98 
 
 		 468 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0591  amino acid permease  57.27 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1844  amino acid permease  57.27 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742156  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0877  amino acid permease  57.27 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4289  amino acid permease-associated region  58.88 
 
 		 468 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4210  amino acid permease-associated region  57.75 
 
 		 467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4045  amino acid permease-associated region  57.75 
 
 		 468 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3200  amino acid permease-associated region  57.53 
 
 		 468 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4321  amino acid permease-associated region  57.75 
 
 		 468 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1487  amino acid transporter  32.84 
 
 		 452 aa  216  9e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.838437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2010  amino acid permease-associated region  34.35 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1325  amino acid permease-associated region  32.61 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0934  amino acid permease-associated region  30.15 
 
 		 388 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0763  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 454 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  26.84 
 
 		 468 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 496 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 496 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  23.76 
 
 		 422 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  22.62 
 
 		 500 aa  86.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  23.72 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  24.58 
 
 		 456 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 506 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  23.97 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  25.26 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  22.49 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  22.8 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  22.49 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  22.49 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  24.89 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  22.49 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  22.49 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 786 aa  81.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  22.3 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  23.13 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  22.66 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  25.26 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  22.25 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 496 aa  80.5  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 		 506 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  22.55 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 497 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 		 516 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  22.7 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  24.45 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 501 aa  76.6  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  23.13 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 641 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  23.28 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  21.99 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  22.88 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  23.26 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  22.1 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  22.1 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  23.89 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 770 aa  74.3  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  27.37 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  25.41 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  28.39 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  21.68 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  23.89 
 
 		 481 aa  73.6  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  22.32 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  28.36 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  22.66 
 
 		 471 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 520 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  25.34 
 
 		 469 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>