More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2010 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2010  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 468 aa  904    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1651  amino acid permease  35.33 
 
 		 468 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1020  amino acid permease  35.62 
 
 		 470 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2325  amino acid permease  35.62 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1106  amino acid permease  35.62 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0591  amino acid permease  35.33 
 
 		 469 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1844  amino acid permease  35.33 
 
 		 469 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742156  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0877  amino acid permease  35.33 
 
 		 469 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1685  amino acid transporter  34.9 
 
 		 468 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179988  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3736  amino acid permease-associated region  36.41 
 
 		 468 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4210  amino acid permease-associated region  35.04 
 
 		 467 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4289  amino acid permease-associated region  35.63 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3200  amino acid permease-associated region  35.12 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4045  amino acid permease-associated region  35.12 
 
 		 468 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4321  amino acid permease-associated region  35.12 
 
 		 468 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45240  putative amino acid permease  37.71 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2591  amino acid permease-associated region  34.35 
 
 		 454 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3841  putative amino acid permease  36.99 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1325  amino acid permease-associated region  29.67 
 
 		 464 aa  153  7e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0934  amino acid permease-associated region  30.18 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1487  amino acid transporter  24.28 
 
 		 452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.838437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0763  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46184  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 462 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 495 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 500 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 462 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 462 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  26.68 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 786 aa  84.3  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  23.67 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 476 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 		 520 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  23.41 
 
 		 513 aa  81.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 515 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  24.81 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 518 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  23.92 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  23.63 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  25.31 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  23.91 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  24.81 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  25.81 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  25.81 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  25.81 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  26.47 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  22.82 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  26.67 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  26.67 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  26.67 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  26.67 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  22.61 
 
 		 490 aa  76.6  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  27.27 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  22.28 
 
 		 462 aa  76.3  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  23.44 
 
 		 516 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  23.27 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  23.23 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  22.16 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 539 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  27.84 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  23.79 
 
 		 521 aa  74.3  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  22.41 
 
 		 482 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  24.34 
 
 		 495 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 494 aa  73.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  27.5 
 
 		 462 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  22.66 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 		 495 aa  72  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 		 465 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  22.2 
 
 		 478 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  22.66 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  23.96 
 
 		 525 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  27.09 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  26.05 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  22.96 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  30.53 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  23.47 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>