181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0763 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0763  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 475 aa  944    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46184  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1106  amino acid permease  31.61 
 
 		 469 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2325  amino acid permease  31.61 
 
 		 469 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1020  amino acid permease  31.39 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0591  amino acid permease  31.39 
 
 		 469 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0877  amino acid permease  31.39 
 
 		 469 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1844  amino acid permease  31.39 
 
 		 469 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742156  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1651  amino acid permease  30.87 
 
 		 468 aa  202  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1487  amino acid transporter  29.34 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.838437  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1685  amino acid transporter  30.73 
 
 		 468 aa  186  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179988  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4045  amino acid permease-associated region  31.44 
 
 		 468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4321  amino acid permease-associated region  31.44 
 
 		 468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4289  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 		 468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4210  amino acid permease-associated region  31.19 
 
 		 467 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3736  amino acid permease-associated region  30.94 
 
 		 468 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3200  amino acid permease-associated region  30.97 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2591  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196035 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0934  amino acid permease-associated region  30.96 
 
 		 388 aa  161  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1325  amino acid permease-associated region  30.82 
 
 		 464 aa  153  7e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45240  putative amino acid permease  27.57 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3841  putative amino acid permease  26.58 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2010  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 468 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  26.2 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  26.48 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.4 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  23.82 
 
 		 478 aa  67  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  21.17 
 
 		 478 aa  67  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  23.13 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  22.34 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  23.34 
 
 		 506 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  21.51 
 
 		 460 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  23.48 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  25.48 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 530 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 468 aa  59.3  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  27.3 
 
 		 482 aa  57  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  25.81 
 
 		 482 aa  57  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  24.82 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  25.22 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  40.91 
 
 		 518 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  24.87 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  25.06 
 
 		 460 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  24.03 
 
 		 521 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  23.96 
 
 		 482 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 		 547 aa  53.5  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  23.18 
 
 		 446 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  23.57 
 
 		 433 aa  53.5  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  23.18 
 
 		 446 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  23.18 
 
 		 446 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0325  amino acid permease-associated region  22.01 
 
 		 462 aa  53.5  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  21.11 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  22.52 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  22.03 
 
 		 503 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 502 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  23.8 
 
 		 519 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  23.47 
 
 		 482 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  22.63 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  22.52 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  24.8 
 
 		 481 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  21.84 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  23.46 
 
 		 458 aa  51.6  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  24.08 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  21.84 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  23.02 
 
 		 496 aa  51.2  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  22.52 
 
 		 466 aa  50.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  21.23 
 
 		 506 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  21.71 
 
 		 495 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  21.55 
 
 		 499 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 449 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  22.71 
 
 		 487 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  26.1 
 
 		 449 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  21.83 
 
 		 462 aa  50.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 485 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  22.92 
 
 		 483 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  22.72 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  24.71 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  20.48 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  20.19 
 
 		 482 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1820  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  23.64 
 
 		 471 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  23.77 
 
 		 482 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  20.4 
 
 		 494 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  23.89 
 
 		 456 aa  49.3  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  23.77 
 
 		 482 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  21.17 
 
 		 463 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 		 495 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  25.39 
 
 		 483 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  22.96 
 
 		 467 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>