More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0325 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0325  amino acid permease-associated region  100 
 
 
462 aa  913    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2325  amino acid permease-associated region  46.58 
 
 
476 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000716314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  45.81 
 
 
478 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  46.77 
 
 
473 aa  435  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  48.63 
 
 
473 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  48.45 
 
 
472 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  46.77 
 
 
473 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  49.31 
 
 
475 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  46.55 
 
 
473 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  49.31 
 
 
473 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  46.77 
 
 
473 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  49.08 
 
 
473 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  49.31 
 
 
475 aa  431  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  49.08 
 
 
475 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  46.27 
 
 
473 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  49.31 
 
 
475 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  46.99 
 
 
473 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  46.77 
 
 
473 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  49.31 
 
 
475 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  47.79 
 
 
472 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  49.31 
 
 
476 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  45.92 
 
 
474 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  45.71 
 
 
474 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  46.44 
 
 
471 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  44.95 
 
 
513 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2786  amino acid permease family protein  45.38 
 
 
478 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000595058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  46.55 
 
 
473 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2716  amino acid permease; arginine permease  45.28 
 
 
474 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000134476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  46.22 
 
 
471 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2998  amino acid permease family protein  45.49 
 
 
474 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000337351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  45.14 
 
 
474 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  46.77 
 
 
473 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  45.14 
 
 
474 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  46 
 
 
468 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  45.61 
 
 
470 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  44.74 
 
 
472 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  42.67 
 
 
466 aa  389  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  42.05 
 
 
468 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5465  amino acid permease-associated region  44.07 
 
 
469 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  hitchhiker  0.00900636 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0660  amino acid transporter  44.59 
 
 
479 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232507  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0694  amino acid permease-associated region  44.59 
 
 
479 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0144358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  41.83 
 
 
468 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  41.83 
 
 
468 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  42.48 
 
 
470 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65850  amino acid ABC transporter permease  42.26 
 
 
470 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397279  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  42.61 
 
 
475 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1143  amino acid permease-associated region  44.27 
 
 
477 aa  378  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00088107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  42.05 
 
 
474 aa  378  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3559  amino acid permease-associated region  44.03 
 
 
485 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  42.22 
 
 
470 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1041  amino acid permease-associated region  43.88 
 
 
467 aa  369  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000184403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  40.92 
 
 
469 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0507  amino acid transporter  44.12 
 
 
524 aa  367  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.229334  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  42 
 
 
470 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  42.86 
 
 
458 aa  366  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1306  amino acid permease  43.14 
 
 
458 aa  348  1e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000234157  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  42.58 
 
 
489 aa  345  8e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  38.51 
 
 
488 aa  343  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01794  S-methylmethionine transporter  41.76 
 
 
465 aa  341  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  42.34 
 
 
489 aa  341  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  37.84 
 
 
488 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  38.05 
 
 
488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  37.87 
 
 
488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  38.3 
 
 
488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  38.3 
 
 
488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  38.15 
 
 
488 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  37.84 
 
 
488 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  37.42 
 
 
488 aa  336  7e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  37.63 
 
 
488 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  40.85 
 
 
520 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  40.85 
 
 
520 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  40.85 
 
 
520 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  40.85 
 
 
520 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  40.85 
 
 
520 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  40.85 
 
 
520 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  38.81 
 
 
490 aa  332  8e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  37.23 
 
 
488 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  40.9 
 
 
520 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  40.77 
 
 
536 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  37.79 
 
 
527 aa  330  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  40.77 
 
 
511 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1821  lysine-specific permease  36.46 
 
 
489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  40 
 
 
514 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  40.34 
 
 
538 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  40.34 
 
 
538 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  40.34 
 
 
511 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2396  amino acid transporter  39.91 
 
 
511 aa  326  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953097  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  40.61 
 
 
489 aa  325  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  40.61 
 
 
489 aa  325  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  40.61 
 
 
489 aa  325  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  40.61 
 
 
489 aa  325  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  40.61 
 
 
489 aa  325  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  40.61 
 
 
489 aa  325  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  40.61 
 
 
489 aa  325  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  40.61 
 
 
489 aa  324  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0126674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1404  amino acid permease-associated region  40.47 
 
 
506 aa  323  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  40.39 
 
 
489 aa  323  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  41.27 
 
 
512 aa  322  7e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  39.74 
 
 
526 aa  322  8e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  40.61 
 
 
489 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>