More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3736 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0591  amino acid permease  78.43 
 
 		 469 aa  684    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1106  amino acid permease  76.12 
 
 		 469 aa  691    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4210  amino acid permease-associated region  98.72 
 
 		 467 aa  871    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2325  amino acid permease  78.65 
 
 		 469 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1844  amino acid permease  78.43 
 
 		 469 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742156  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1685  amino acid transporter  96.15 
 
 		 468 aa  861    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179988  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1651  amino acid permease  78.21 
 
 		 468 aa  702    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4289  amino acid permease-associated region  92.31 
 
 		 468 aa  816    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1020  amino acid permease  78.43 
 
 		 470 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4045  amino acid permease-associated region  95.73 
 
 		 468 aa  831    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3736  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 468 aa  917    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0877  amino acid permease  78.43 
 
 		 469 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3200  amino acid permease-associated region  95.94 
 
 		 468 aa  835    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4321  amino acid permease-associated region  95.73 
 
 		 468 aa  831    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2591  amino acid permease-associated region  58.2 
 
 		 454 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45240  putative amino acid permease  56.43 
 
 		 455 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3841  putative amino acid permease  55.34 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2010  amino acid permease-associated region  35.99 
 
 		 468 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1487  amino acid transporter  31.85 
 
 		 452 aa  202  8e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.838437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0763  amino acid permease-associated region  30.89 
 
 		 475 aa  172  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46184  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1325  amino acid permease-associated region  30.6 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0934  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.07 
 
 		 489 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  25.51 
 
 		 476 aa  98.2  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  21.72 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  21.72 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  21.72 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  21.72 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  21.72 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  21.51 
 
 		 471 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  21.51 
 
 		 471 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 492 aa  90.9  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  22.53 
 
 		 471 aa  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 461 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 481 aa  89.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  23.92 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 500 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  22.58 
 
 		 471 aa  87.8  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 454 aa  87.4  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  21.67 
 
 		 460 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  21.94 
 
 		 471 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 486 aa  86.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  23.92 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  25.51 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  22.93 
 
 		 500 aa  84  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  21.02 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  23.55 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  22.62 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 764 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 		 478 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  22.18 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  24.82 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  24.77 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  23.19 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  22.41 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  22.41 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  23.59 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  23.78 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  22.2 
 
 		 467 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  21.99 
 
 		 467 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 485 aa  79.7  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  22.2 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  22.46 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  21.99 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 518 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  21.78 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  22.25 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  22.76 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  22.57 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  25.1 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  21.34 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  22.57 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 		 538 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  26.82 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  24.28 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  23.54 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  23.36 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  26.64 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  24.58 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  21.26 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  22.99 
 
 		 486 aa  74.7  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  22.99 
 
 		 486 aa  74.7  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  21.72 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  22.98 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  22.78 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 427 aa  73.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  21.96 
 
 		 462 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1055  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.123493  hitchhiker  0.0000000766356 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  24.03 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>